More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6208 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.45 
 
 
2051 aa  1044    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  32.85 
 
 
1833 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 
1914 aa  835    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  30.81 
 
 
1712 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  30.73 
 
 
2279 aa  704    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  34.1 
 
 
2109 aa  659    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  34.85 
 
 
2361 aa  829    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.93 
 
 
1780 aa  955    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.33 
 
 
1901 aa  823    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.09 
 
 
1805 aa  758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  33.38 
 
 
1934 aa  816    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.88 
 
 
1804 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.66 
 
 
2017 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.54 
 
 
1794 aa  832    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  30.45 
 
 
1850 aa  842    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.3 
 
 
1797 aa  838    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.69 
 
 
1795 aa  798    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.06 
 
 
1808 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.63 
 
 
1797 aa  683    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  45.14 
 
 
1922 aa  1480    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  33.01 
 
 
1837 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
1644 aa  653    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  32.16 
 
 
1809 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
1942 aa  811    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.29 
 
 
1822 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  30.03 
 
 
1811 aa  749    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
1805 aa  933    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
1932 aa  919    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
1885 aa  3803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.25 
 
 
1780 aa  682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  31.87 
 
 
2077 aa  793    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  31.07 
 
 
2303 aa  676    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  34.25 
 
 
1908 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  32.44 
 
 
1871 aa  833    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  31.17 
 
 
2272 aa  698    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.2 
 
 
1774 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.87 
 
 
1845 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  30.66 
 
 
1697 aa  633  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.73 
 
 
1668 aa  619  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.16 
 
 
1663 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.55 
 
 
1739 aa  582  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.67 
 
 
1836 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  29.82 
 
 
1685 aa  506  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  38.47 
 
 
670 aa  499  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.67 
 
 
1685 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  31.66 
 
 
1788 aa  492  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.03 
 
 
1748 aa  487  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.07 
 
 
1885 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.12 
 
 
1832 aa  460  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  27.72 
 
 
1710 aa  437  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  30.45 
 
 
1756 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.92 
 
 
1744 aa  417  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.84 
 
 
1685 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  26.06 
 
 
1682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
1636 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.88 
 
 
1682 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  24.18 
 
 
2312 aa  331  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 
1123 aa  328  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  46.08 
 
 
982 aa  308  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
1637 aa  308  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 
1643 aa  306  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  27.41 
 
 
1064 aa  306  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
1629 aa  302  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
1313 aa  301  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 
1649 aa  296  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 
765 aa  295  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 
902 aa  291  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  25.95 
 
 
1112 aa  289  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
606 aa  288  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.8 
 
 
661 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.88 
 
 
968 aa  285  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
667 aa  283  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1007 aa  283  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 
724 aa  282  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
1287 aa  281  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
932 aa  281  9e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 
738 aa  281  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.27 
 
 
763 aa  280  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  40.51 
 
 
544 aa  277  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
817 aa  277  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 
631 aa  274  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  39.09 
 
 
641 aa  274  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
873 aa  273  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
1791 aa  273  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
718 aa  273  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 
898 aa  273  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
947 aa  272  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
974 aa  271  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
644 aa  271  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 
767 aa  271  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1127 aa  270  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
645 aa  270  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
1726 aa  270  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  41.1 
 
 
606 aa  269  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  43.57 
 
 
559 aa  270  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
1452 aa  269  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  40.66 
 
 
651 aa  269  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  41.18 
 
 
651 aa  269  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  41.6 
 
 
735 aa  268  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
785 aa  268  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>