More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1160 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  31.65 
 
 
1809 aa  760    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  73.04 
 
 
2272 aa  3066    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
2077 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  30.49 
 
 
1837 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.38 
 
 
1780 aa  698    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  100 
 
 
2303 aa  4763    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.69 
 
 
1774 aa  780    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.97 
 
 
2361 aa  861    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.04 
 
 
1780 aa  877    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.35 
 
 
1901 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.31 
 
 
1805 aa  877    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  32.11 
 
 
1934 aa  924    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  35.56 
 
 
1804 aa  885    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.57 
 
 
2017 aa  789    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.49 
 
 
1794 aa  815    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  35.78 
 
 
1850 aa  900    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.62 
 
 
1797 aa  839    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.84 
 
 
1795 aa  858    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.75 
 
 
1808 aa  860    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 
1914 aa  928    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.5 
 
 
1668 aa  689    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.41 
 
 
1885 aa  666    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  31.89 
 
 
1922 aa  740    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.15 
 
 
1822 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.14 
 
 
1845 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  30.27 
 
 
1697 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
1942 aa  976    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.96 
 
 
1663 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  33.57 
 
 
1811 aa  772    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 
1805 aa  906    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
1932 aa  897    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 
1908 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  71.4 
 
 
2279 aa  3120    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  28.16 
 
 
1836 aa  732    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  30.36 
 
 
1833 aa  858    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
1644 aa  698    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  29.13 
 
 
2109 aa  802    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  36.67 
 
 
2051 aa  891    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  30.97 
 
 
1712 aa  673    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  30.15 
 
 
1871 aa  602  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.72 
 
 
1685 aa  570  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.52 
 
 
1685 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.51 
 
 
1797 aa  550  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.08 
 
 
1748 aa  535  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.11 
 
 
1788 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 
670 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  26.24 
 
 
1739 aa  485  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  26.11 
 
 
1744 aa  434  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.47 
 
 
1756 aa  426  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  26.82 
 
 
1685 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.82 
 
 
1832 aa  414  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  24.95 
 
 
1637 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.81 
 
 
1710 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.33 
 
 
1885 aa  400  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 
1636 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 
1629 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  24.93 
 
 
1643 aa  383  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  25.65 
 
 
1682 aa  363  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  25.54 
 
 
1682 aa  361  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
1123 aa  360  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 
1726 aa  338  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  25.52 
 
 
1060 aa  305  9e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
1649 aa  298  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  24.4 
 
 
1064 aa  290  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  25.14 
 
 
1112 aa  285  6.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
969 aa  279  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.27 
 
 
1123 aa  270  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
1433 aa  259  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
869 aa  258  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
918 aa  244  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
1131 aa  238  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
785 aa  238  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  29.06 
 
 
1418 aa  237  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  29.06 
 
 
1417 aa  237  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
1027 aa  237  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1611 aa  233  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1632 aa  233  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1059 aa  232  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
1236 aa  230  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1236 aa  229  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1236 aa  229  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1578 aa  229  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
764 aa  228  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1267 aa  228  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  30.12 
 
 
1188 aa  228  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
1044 aa  226  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
1124 aa  226  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
865 aa  224  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
765 aa  225  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  23.2 
 
 
1473 aa  224  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1362 aa  223  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
973 aa  223  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
1245 aa  223  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
1501 aa  221  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 
846 aa  220  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
902 aa  219  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.94 
 
 
1473 aa  219  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.94 
 
 
1473 aa  219  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
810 aa  219  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  31.89 
 
 
666 aa  219  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>