More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3535 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.88 
 
 
1774 aa  1086    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.43 
 
 
1663 aa  750    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  35.56 
 
 
2303 aa  840    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.26 
 
 
1822 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.82 
 
 
1797 aa  725    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
1644 aa  713    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  34.14 
 
 
1922 aa  907    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  41.44 
 
 
2361 aa  1237    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.37 
 
 
1942 aa  1499    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.83 
 
 
1780 aa  1447    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  48.34 
 
 
1901 aa  1752    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  57.53 
 
 
1805 aa  1951    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  50.93 
 
 
1934 aa  1497    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.89 
 
 
1668 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  100 
 
 
1804 aa  3700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  56.2 
 
 
2017 aa  1731    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  53.66 
 
 
1794 aa  1880    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  50.11 
 
 
1850 aa  1758    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  53.56 
 
 
1797 aa  1903    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  55.08 
 
 
1795 aa  1937    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  42.95 
 
 
1808 aa  1402    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  35.77 
 
 
2279 aa  894    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  35.25 
 
 
1845 aa  892    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  32.52 
 
 
2109 aa  766    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  51.25 
 
 
1811 aa  1842    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  29.51 
 
 
1871 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  41.8 
 
 
2077 aa  1145    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  33.58 
 
 
1809 aa  863    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  36.15 
 
 
2272 aa  853    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.58 
 
 
1885 aa  800    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  42.04 
 
 
1908 aa  1192    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
1123 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  29.82 
 
 
1697 aa  793    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  35.2 
 
 
1833 aa  952    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  33.81 
 
 
1837 aa  869    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  29.96 
 
 
1712 aa  785    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  41.09 
 
 
1932 aa  1152    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  62.5 
 
 
670 aa  871    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.75 
 
 
1780 aa  981    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  40.94 
 
 
1805 aa  1157    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.75 
 
 
1836 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  41.49 
 
 
2051 aa  1325    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 
1914 aa  1021    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27.85 
 
 
1739 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.28 
 
 
1832 aa  561  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  26.39 
 
 
1685 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.26 
 
 
1685 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.92 
 
 
1885 aa  547  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.77 
 
 
1748 aa  500  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  25.72 
 
 
1685 aa  489  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  25.03 
 
 
1744 aa  489  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  26.98 
 
 
1788 aa  479  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  25.84 
 
 
1756 aa  473  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  25.2 
 
 
1710 aa  467  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.99 
 
 
1682 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  25.28 
 
 
1682 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 
1637 aa  413  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.91 
 
 
1112 aa  399  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 
1636 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  27.07 
 
 
1060 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
494 aa  356  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  25.07 
 
 
1064 aa  345  5.999999999999999e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 
1629 aa  329  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 
1649 aa  318  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
1643 aa  313  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  52.05 
 
 
437 aa  311  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  52.1 
 
 
443 aa  310  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.02 
 
 
1123 aa  309  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
1072 aa  306  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  52.29 
 
 
342 aa  306  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
439 aa  296  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  23.91 
 
 
1473 aa  290  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  23.91 
 
 
1473 aa  290  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
680 aa  288  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 
715 aa  287  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  23.91 
 
 
1473 aa  286  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 
431 aa  283  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 
699 aa  279  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 
594 aa  278  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  54.44 
 
 
437 aa  278  1.0000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
1726 aa  275  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
641 aa  272  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  49.81 
 
 
591 aa  272  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
1036 aa  271  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4267  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
920 aa  270  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.427851  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
675 aa  270  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  47.18 
 
 
971 aa  268  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
928 aa  264  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 
585 aa  263  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  45.51 
 
 
468 aa  262  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 
440 aa  261  7e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  48.4 
 
 
407 aa  260  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4136  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
440 aa  260  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000660181  hitchhiker  0.00876613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
688 aa  259  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
470 aa  259  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  46.48 
 
 
468 aa  255  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 
537 aa  254  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
468 aa  253  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
551 aa  252  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  22.9 
 
 
1255 aa  251  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>