160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49028 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  44.95 
 
 
1060 aa  917    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  100 
 
 
1064 aa  2209    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  26.15 
 
 
1850 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.17 
 
 
1780 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.83 
 
 
1795 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
1908 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.63 
 
 
1934 aa  382  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.31 
 
 
1797 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  28.08 
 
 
2361 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 
1805 aa  376  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 
1932 aa  373  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.87 
 
 
2051 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.23 
 
 
1901 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  25.76 
 
 
2077 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
1942 aa  366  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.04 
 
 
1794 aa  357  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  26.94 
 
 
1112 aa  355  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.17 
 
 
1804 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.79 
 
 
1808 aa  346  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.22 
 
 
1805 aa  342  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.43 
 
 
1822 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.3 
 
 
1833 aa  325  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  26.79 
 
 
1922 aa  321  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  25.65 
 
 
1697 aa  310  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  26.22 
 
 
1871 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  24.44 
 
 
1811 aa  303  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.11 
 
 
2017 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  26.79 
 
 
1885 aa  280  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.04 
 
 
1663 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.06 
 
 
1797 aa  273  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.89 
 
 
1914 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  25.96 
 
 
1809 aa  270  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  24.32 
 
 
1712 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.8 
 
 
1774 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.4 
 
 
2303 aa  264  4.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  23.7 
 
 
1668 aa  262  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  24.88 
 
 
1837 aa  261  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  25.87 
 
 
2109 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.52 
 
 
1123 aa  254  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.44 
 
 
1845 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.5 
 
 
1780 aa  251  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.01 
 
 
2279 aa  248  4e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  23.54 
 
 
1644 aa  241  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  25.93 
 
 
1739 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.01 
 
 
2272 aa  239  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  23.5 
 
 
1255 aa  224  8e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  23.89 
 
 
1836 aa  211  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
1123 aa  200  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.47 
 
 
900 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  23.68 
 
 
1685 aa  181  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  23.52 
 
 
1685 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.25 
 
 
1885 aa  176  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  21.97 
 
 
1473 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  23.34 
 
 
1788 aa  172  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  22.13 
 
 
1473 aa  170  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  22.13 
 
 
1473 aa  170  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  23.1 
 
 
1086 aa  170  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  23.11 
 
 
1710 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  24.09 
 
 
1685 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50616  predicted protein  22.45 
 
 
1015 aa  162  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00719688  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 
670 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  21.47 
 
 
1744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.41 
 
 
1748 aa  149  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  23.33 
 
 
1682 aa  148  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  22.63 
 
 
1682 aa  144  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  22.6 
 
 
1643 aa  141  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  22.79 
 
 
1636 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  22.68 
 
 
1637 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  24.74 
 
 
1756 aa  118  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  20.81 
 
 
1832 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  22.32 
 
 
1629 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  22.84 
 
 
1649 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50617  predicted protein  21.71 
 
 
859 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00889588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 
1726 aa  85.1  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  22.75 
 
 
1022 aa  80.1  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03102  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12550)  21.47 
 
 
2312 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.461392  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.51 
 
 
1403 aa  68.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  22.76 
 
 
1123 aa  68.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.65 
 
 
1089 aa  67.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  23.23 
 
 
1320 aa  66.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  22.03 
 
 
1029 aa  66.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  24.92 
 
 
970 aa  65.9  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  22.08 
 
 
1398 aa  65.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  24.91 
 
 
981 aa  65.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  25.81 
 
 
1055 aa  64.7  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.64 
 
 
1080 aa  64.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  23.1 
 
 
954 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  23.72 
 
 
982 aa  62  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  23.88 
 
 
1067 aa  62  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  22.89 
 
 
1093 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.82 
 
 
1429 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  24.62 
 
 
937 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  23.34 
 
 
1235 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  22.99 
 
 
1139 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.82 
 
 
1081 aa  59.7  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  22.42 
 
 
966 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  24.47 
 
 
963 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  23.06 
 
 
1118 aa  58.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  23.36 
 
 
1109 aa  58.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.3 
 
 
1134 aa  58.2  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>