More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3277 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
970 aa  1857    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  53.48 
 
 
982 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  54.18 
 
 
967 aa  779    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 
983 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 
993 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  38.62 
 
 
916 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  36.93 
 
 
1006 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  38.45 
 
 
953 aa  341  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  31.8 
 
 
967 aa  284  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 
954 aa  252  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  37.36 
 
 
981 aa  233  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 
992 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  36.66 
 
 
973 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
1005 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 
1084 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 
999 aa  195  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 
1013 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 
900 aa  161  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 
937 aa  137  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  36.24 
 
 
964 aa  135  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.72 
 
 
1054 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 
1029 aa  118  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.6 
 
 
1020 aa  107  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  30.09 
 
 
1051 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 
1022 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
862 aa  105  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.5 
 
 
1034 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
1105 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.35 
 
 
1075 aa  98.6  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.92 
 
 
1029 aa  98.2  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.38 
 
 
1071 aa  94.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 
1402 aa  94.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.83 
 
 
1175 aa  94.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
895 aa  93.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  25.13 
 
 
2279 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  30.12 
 
 
1007 aa  92.8  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.35 
 
 
1422 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  30.13 
 
 
872 aa  92.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.93 
 
 
1227 aa  91.3  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.17 
 
 
1805 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.06 
 
 
1116 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
881 aa  89  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.87 
 
 
713 aa  88.6  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.75 
 
 
1015 aa  87.8  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.77 
 
 
2017 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  25.54 
 
 
2051 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.76 
 
 
1429 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.49 
 
 
1295 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 
973 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  31.01 
 
 
1109 aa  84.7  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.91 
 
 
1808 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.35 
 
 
1080 aa  82.8  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.04 
 
 
1081 aa  82  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.23 
 
 
1118 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 
1067 aa  82  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
1403 aa  81.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.64 
 
 
1123 aa  81.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.93 
 
 
1123 aa  81.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.32 
 
 
1141 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
952 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.65 
 
 
1797 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  28.83 
 
 
914 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  32.12 
 
 
957 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  32.01 
 
 
952 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 
1139 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.97 
 
 
1118 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 
905 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.03 
 
 
1833 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 
212 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.08 
 
 
1441 aa  79.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
1942 aa  79.3  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.58 
 
 
1037 aa  79  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  22.49 
 
 
2303 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.65 
 
 
1198 aa  78.2  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.45 
 
 
1794 aa  78.2  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  27.02 
 
 
977 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.46 
 
 
1271 aa  78.2  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  20.88 
 
 
1934 aa  77.8  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.13 
 
 
1403 aa  77.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  56.45 
 
 
218 aa  77  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  27.64 
 
 
919 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.97 
 
 
1291 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 
1914 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
1235 aa  77  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.91 
 
 
1150 aa  77  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  24.47 
 
 
670 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  30.91 
 
 
1685 aa  77  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 
959 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  30.91 
 
 
1685 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.02 
 
 
1118 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.89 
 
 
210 aa  75.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 
1043 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  30.63 
 
 
723 aa  75.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 
1141 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  27.53 
 
 
1090 aa  75.5  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 
1141 aa  75.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.35 
 
 
1795 aa  75.1  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  24.87 
 
 
1141 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.37 
 
 
1148 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>