More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5023 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  53.44 
 
 
970 aa  796    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
982 aa  1902    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  54.48 
 
 
967 aa  817    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  41.13 
 
 
916 aa  502  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  41.14 
 
 
983 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  38.08 
 
 
993 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  34.06 
 
 
1006 aa  389  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 
953 aa  341  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  35.66 
 
 
954 aa  326  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 
967 aa  262  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
973 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
992 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 
981 aa  245  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 
1084 aa  209  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 
1005 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  32.9 
 
 
900 aa  203  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 
999 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 
1013 aa  183  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  33.97 
 
 
964 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 
959 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  29.95 
 
 
1051 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  32.11 
 
 
1054 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 
1022 aa  131  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.16 
 
 
1015 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.49 
 
 
1029 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.61 
 
 
1067 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.14 
 
 
1227 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.71 
 
 
1075 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.8 
 
 
1034 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.66 
 
 
1089 aa  106  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.61 
 
 
1020 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
895 aa  103  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
1402 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 
937 aa  99.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.27 
 
 
1141 aa  99  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 
1160 aa  98.6  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.65 
 
 
1271 aa  98.2  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.38 
 
 
1295 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.37 
 
 
1105 aa  96.3  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
881 aa  97.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.5 
 
 
1029 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  28.16 
 
 
862 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.11 
 
 
1116 aa  94.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.88 
 
 
1422 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
1148 aa  93.2  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  50.38 
 
 
562 aa  93.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 
1007 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  24.79 
 
 
1048 aa  92  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 
1037 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  29.81 
 
 
713 aa  91.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.95 
 
 
1175 aa  91.3  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.42 
 
 
1149 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.18 
 
 
1123 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.36 
 
 
1080 aa  90.1  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1139 aa  89.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.65 
 
 
1441 aa  89.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.69 
 
 
1122 aa  89  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.57 
 
 
1134 aa  88.6  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  22.81 
 
 
1934 aa  88.2  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.15 
 
 
1118 aa  88.2  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.6 
 
 
1403 aa  87.8  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  25.64 
 
 
1138 aa  87.4  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.07 
 
 
1118 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  31 
 
 
1109 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
554 aa  85.9  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  27.49 
 
 
914 aa  85.5  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.02 
 
 
1429 aa  85.5  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  25.31 
 
 
1126 aa  85.1  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 
1403 aa  85.1  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.99 
 
 
1795 aa  84.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  27.83 
 
 
1071 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.82 
 
 
1151 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.15 
 
 
2279 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.65 
 
 
1291 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  25.19 
 
 
2051 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.73 
 
 
1808 aa  83.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  29.4 
 
 
1348 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.25 
 
 
1797 aa  81.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  29.19 
 
 
1349 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  23.27 
 
 
1123 aa  81.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  27.96 
 
 
977 aa  81.6  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  24.5 
 
 
864 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.49 
 
 
1822 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 
1151 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.66 
 
 
1114 aa  80.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.06 
 
 
1833 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  27.98 
 
 
2361 aa  79.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
1398 aa  79.7  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
1400 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.19 
 
 
2017 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.33 
 
 
1794 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  56.34 
 
 
212 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.13 
 
 
1805 aa  78.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  27.14 
 
 
1685 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.35 
 
 
1132 aa  77.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 
1342 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  26.38 
 
 
1663 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
544 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.39 
 
 
1093 aa  77  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 
956 aa  77  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>