More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4205 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  62.15 
 
 		 957 aa  1006    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  100 
 
 		 963 aa  1850    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  56.1 
 
 		 963 aa  893    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  36.41 
 
 		 937 aa  355  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 973 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  34.1 
 
 		 952 aa  225  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  33.74 
 
 		 992 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.55 
 
 		 1029 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 		 954 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 900 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.29 
 
 		 1006 aa  111  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.5 
 
 		 1067 aa  110  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 1007 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.84 
 
 		 1055 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 973 aa  107  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 1235 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.31 
 
 		 1089 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  30.06 
 
 		 1034 aa  105  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  33.08 
 
 		 1123 aa  104  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 983 aa  101  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 965 aa  98.6  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.55 
 
 		 916 aa  98.6  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.76 
 
 		 1291 aa  97.8  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 		 1048 aa  96.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 1005 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  29.62 
 
 		 1133 aa  92.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.95 
 
 		 1055 aa  92  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  29.38 
 
 		 1788 aa  92  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 1190 aa  92  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 1193 aa  91.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 		 1105 aa  90.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  30.75 
 
 		 959 aa  89.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.97 
 
 		 1122 aa  90.1  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.22 
 
 		 1080 aa  88.6  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.83 
 
 		 1148 aa  88.2  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 		 1050 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.27 
 
 		 1050 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.88 
 
 		 1014 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.21 
 
 		 1826 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.78 
 
 		 1160 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  28.91 
 
 		 1264 aa  86.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 		 1037 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 921 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  26.04 
 
 		 921 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.49 
 
 		 1123 aa  85.9  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  28.61 
 
 		 1697 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  25.9 
 
 		 921 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 		 1403 aa  84.7  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29 
 
 		 1403 aa  85.1  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  30.4 
 
 		 1163 aa  84.7  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 953 aa  84.7  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.65 
 
 		 1134 aa  84.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.08 
 
 		 1150 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  24.65 
 
 		 1871 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.76 
 
 		 1053 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 1398 aa  84  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.22 
 
 		 1081 aa  84  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.27 
 
 		 1141 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  30.96 
 
 		 1036 aa  83.2  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 1161 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 998 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.36 
 
 		 2017 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.37 
 
 		 1744 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.85 
 
 		 1121 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  33.56 
 
 		 1153 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 		 1138 aa  81.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  31.83 
 
 		 1198 aa  81.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.93 
 
 		 1149 aa  81.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 975 aa  81.3  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.15 
 
 		 1117 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 956 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 881 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.64 
 
 		 1377 aa  80.1  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.03 
 
 		 1013 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.63 
 
 		 982 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.41 
 
 		 1055 aa  79.7  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  29.24 
 
 		 1084 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 		 927 aa  78.2  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 		 970 aa  77  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 1141 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  31.57 
 
 		 1065 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 1636 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 1141 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  29.2 
 
 		 872 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  23.9 
 
 		 1850 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  31.23 
 
 		 1013 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 1015 aa  77  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 895 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 1311 aa  76.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.15 
 
 		 1797 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  21.16 
 
 		 1932 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 864 aa  76.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.97 
 
 		 1063 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  29.17 
 
 		 1885 aa  75.1  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.05 
 
 		 1151 aa  75.1  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  21.16 
 
 		 1805 aa  75.1  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 		 1349 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  37.13 
 
 		 937 aa  74.7  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.12 
 
 		 1175 aa  74.7  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>