More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0348 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  48.41 
 
 
965 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
975 aa  1907    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  40.12 
 
 
1007 aa  545  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 
1022 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
992 aa  112  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
973 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.26 
 
 
1141 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.75 
 
 
1139 aa  100  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.37 
 
 
1116 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.58 
 
 
1138 aa  95.9  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.11 
 
 
1122 aa  95.1  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  31.21 
 
 
1118 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.58 
 
 
967 aa  92.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.7 
 
 
1148 aa  92  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 
1048 aa  91.3  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  31.3 
 
 
1053 aa  90.9  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.07 
 
 
1360 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 
1403 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.69 
 
 
1029 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  31.28 
 
 
1118 aa  88.2  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.36 
 
 
1712 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.55 
 
 
1175 aa  87.4  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.79 
 
 
1013 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.46 
 
 
1067 aa  86.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.09 
 
 
1150 aa  85.9  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.43 
 
 
1291 aa  84.7  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 
983 aa  84.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.75 
 
 
1055 aa  82.4  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 
1644 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.46 
 
 
1006 aa  82  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  23.48 
 
 
1402 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.21 
 
 
966 aa  82.4  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  26.67 
 
 
1054 aa  82  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.68 
 
 
1774 aa  81.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  26.43 
 
 
1697 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 
1015 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
1094 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.65 
 
 
1160 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 
1046 aa  79  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.45 
 
 
1422 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1142 aa  78.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  25.21 
 
 
1151 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.42 
 
 
916 aa  78.2  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 
993 aa  77.8  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.57 
 
 
1403 aa  77.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  30.15 
 
 
957 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 
1151 aa  77  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  20.95 
 
 
1797 aa  75.5  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  26.04 
 
 
2109 aa  75.5  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  29.5 
 
 
1101 aa  75.1  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.22 
 
 
1832 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  25.99 
 
 
864 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 
852 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.19 
 
 
1117 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  25.22 
 
 
1871 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.21 
 
 
1109 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  21 
 
 
2303 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 
932 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.49 
 
 
1055 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.89 
 
 
1441 aa  72  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.54 
 
 
1808 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.45 
 
 
1805 aa  71.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.91 
 
 
1093 aa  71.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.75 
 
 
1081 aa  70.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  20.86 
 
 
2279 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  29.08 
 
 
1132 aa  70.1  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 
937 aa  70.1  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  20.45 
 
 
1805 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  20.17 
 
 
1932 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  24.45 
 
 
1833 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  28.1 
 
 
1289 aa  68.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.22 
 
 
1034 aa  68.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.61 
 
 
1123 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  22.54 
 
 
1914 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
1298 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
1235 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  26.63 
 
 
1123 aa  67.4  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 
900 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 
998 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.02 
 
 
1126 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.64 
 
 
1134 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.27 
 
 
1666 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  24.06 
 
 
1183 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  24.91 
 
 
1020 aa  66.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  24.08 
 
 
1836 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.35 
 
 
1075 aa  66.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.8 
 
 
1055 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  23.35 
 
 
1885 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  19.22 
 
 
1794 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.63 
 
 
1227 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 
940 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.82 
 
 
1295 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
1333 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  25.86 
 
 
1141 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  25.86 
 
 
1141 aa  65.1  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  21.1 
 
 
2272 aa  65.1  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.48 
 
 
1005 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.11 
 
 
1149 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.94 
 
 
1795 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26 
 
 
1685 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>