229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4548 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4548  ATPase-like protein  100 
 
 		 1053 aa  1993    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  27.97 
 
 		 1132 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 975 aa  99  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 973 aa  95.9  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  26.35 
 
 		 1090 aa  94.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.45 
 
 		 1422 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.63 
 
 		 1123 aa  92.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  30.49 
 
 		 1123 aa  92  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 954 aa  92  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 993 aa  90.9  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 983 aa  89.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  31.1 
 
 		 1029 aa  88.6  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6477  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 603 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  30.26 
 
 		 1036 aa  87  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  35.58 
 
 		 1051 aa  87  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 992 aa  85.5  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  25.46 
 
 		 967 aa  84.7  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1555  hypothetical protein  37.16 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  39.27 
 
 		 1054 aa  83.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 		 900 aa  82.4  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.59 
 
 		 1121 aa  81.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  26.75 
 
 		 1114 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 1141 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 1141 aa  79.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 938 aa  79  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 966 aa  79  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.08 
 
 		 1150 aa  78.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.2 
 
 		 1006 aa  78.2  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  30.64 
 
 		 867 aa  77.4  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 982 aa  77.4  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 927 aa  77  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1429 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.8 
 
 		 1118 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.78 
 
 		 1080 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 		 1022 aa  73.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  30.97 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 1198 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  27.37 
 
 		 2109 aa  71.6  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 1403 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.38 
 
 		 1126 aa  70.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.62 
 
 		 1134 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  22.52 
 
 		 1079 aa  70.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  32.44 
 
 		 1007 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  27.71 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.51 
 
 		 1071 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.93 
 
 		 1441 aa  69.3  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 		 959 aa  68.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.96 
 
 		 1029 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  28.27 
 
 		 1133 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.04 
 
 		 1118 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 940 aa  66.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  22.19 
 
 		 2279 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  22.02 
 
 		 2303 aa  65.9  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28 
 
 		 1089 aa  65.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 1148 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  34.23 
 
 		 957 aa  65.1  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.5 
 
 		 1403 aa  64.7  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  31.18 
 
 		 916 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 1013 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 1141 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  29.91 
 
 		 922 aa  62.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.84 
 
 		 1271 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  22.22 
 
 		 2051 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  27.3 
 
 		 977 aa  62  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 723 aa  62  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 786 aa  62  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27 
 
 		 1005 aa  62  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  33.68 
 
 		 894 aa  61.6  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.55 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 963 aa  61.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.64 
 
 		 494 aa  60.1  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  32.67 
 
 		 964 aa  59.7  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  22.14 
 
 		 1908 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  26.21 
 
 		 970 aa  59.7  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.87 
 
 		 1037 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  29.75 
 
 		 927 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 932 aa  59.3  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  32.68 
 
 		 937 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.3 
 
 		 1067 aa  58.9  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.89 
 
 		 1075 aa  58.9  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.72 
 
 		 1780 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 959 aa  58.9  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 1161 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.94 
 
 		 1468 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 981 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.73 
 
 		 1048 aa  58.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  29.94 
 
 		 892 aa  58.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.92 
 
 		 1117 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 		 1402 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 1151 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.04 
 
 		 2272 aa  57.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  22.29 
 
 		 1850 aa  57.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 947 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 1000 aa  57.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 		 925 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.91 
 
 		 1034 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.63 
 
 		 1175 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>