More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4275 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
894 aa  1690    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  55.72 
 
 
950 aa  732    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  42.76 
 
 
930 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  43.09 
 
 
929 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  42.05 
 
 
928 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  41.81 
 
 
937 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  41.81 
 
 
937 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  41.27 
 
 
937 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  42.59 
 
 
940 aa  450  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  41.62 
 
 
905 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  40.88 
 
 
936 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  41.97 
 
 
903 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 
918 aa  426  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  37.55 
 
 
925 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 
919 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  37.83 
 
 
923 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 
911 aa  308  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  34.68 
 
 
928 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 
928 aa  280  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 
920 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.26 
 
 
946 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  32.76 
 
 
955 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
938 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  32.66 
 
 
923 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.67 
 
 
879 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  40.96 
 
 
884 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.8 
 
 
927 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.77 
 
 
919 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.32 
 
 
923 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  31.86 
 
 
961 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 
904 aa  177  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 
953 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  36.74 
 
 
922 aa  174  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 
913 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 
929 aa  168  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  42.6 
 
 
889 aa  168  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  39.1 
 
 
940 aa  168  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 
916 aa  158  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  45.18 
 
 
240 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.37 
 
 
910 aa  153  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  33.53 
 
 
934 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.17 
 
 
917 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
1000 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 
1064 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.38 
 
 
919 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  28.41 
 
 
919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  33.48 
 
 
923 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  46.07 
 
 
927 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 
927 aa  111  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  36.35 
 
 
915 aa  109  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  44.92 
 
 
913 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  40.54 
 
 
884 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 
959 aa  104  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  27.93 
 
 
977 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 
995 aa  94.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  40 
 
 
913 aa  92.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 
894 aa  92  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 
998 aa  90.9  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 
910 aa  90.5  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  39.31 
 
 
893 aa  89.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 
997 aa  88.2  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
881 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
881 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  40.56 
 
 
876 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 
909 aa  87.4  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  41.26 
 
 
189 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  43.36 
 
 
946 aa  86.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 
998 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  47.01 
 
 
892 aa  85.5  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 
932 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 
951 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  29.26 
 
 
919 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 
947 aa  76.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.46 
 
 
1006 aa  73.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 
897 aa  73.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.35 
 
 
1422 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
877 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 
992 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 
966 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 
948 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
1050 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.6 
 
 
1050 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  35.43 
 
 
960 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 
953 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 
943 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.53 
 
 
914 aa  65.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  30.59 
 
 
929 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  35.32 
 
 
955 aa  65.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  30.31 
 
 
835 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  24.89 
 
 
1048 aa  65.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
921 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  32.96 
 
 
956 aa  64.7  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 
921 aa  64.7  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30 
 
 
921 aa  64.7  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  28.54 
 
 
982 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.06 
 
 
921 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.48 
 
 
1403 aa  64.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 
974 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>