More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2089 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
959 aa  1856    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  32.64 
 
 
998 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 
1089 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 
919 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 
956 aa  181  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  27.95 
 
 
895 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 
956 aa  115  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
950 aa  104  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  25.93 
 
 
862 aa  94  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.12 
 
 
919 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
919 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.7 
 
 
919 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 
913 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
1030 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  51.04 
 
 
909 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
889 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.81 
 
 
1151 aa  69.3  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  68.63 
 
 
963 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 
788 aa  68.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  47.44 
 
 
855 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  36.06 
 
 
919 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 
920 aa  67.4  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  42.86 
 
 
963 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 
923 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 
952 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
882 aa  67  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  46.91 
 
 
938 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 
927 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  48.1 
 
 
957 aa  64.7  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 
953 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 
876 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  46.88 
 
 
937 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 
1074 aa  64.3  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  26.88 
 
 
799 aa  63.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
910 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
926 aa  63.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  56.16 
 
 
893 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 
893 aa  62.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 
912 aa  62.4  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  28.74 
 
 
961 aa  62.4  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  49.09 
 
 
900 aa  62  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  34.14 
 
 
947 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  62.75 
 
 
903 aa  62  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 
897 aa  61.6  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1460  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 
224 aa  61.6  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.659068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  60.71 
 
 
981 aa  61.6  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 
973 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 
904 aa  61.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.83 
 
 
938 aa  60.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
208 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 
218 aa  60.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 
928 aa  61.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 
903 aa  61.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.98 
 
 
981 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.72 
 
 
921 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
994 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
921 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  44.21 
 
 
929 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.72 
 
 
921 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  39.56 
 
 
884 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  56.86 
 
 
833 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  42.68 
 
 
977 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 
845 aa  60.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  58.18 
 
 
1001 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
1137 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
175 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 
755 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 
270 aa  59.7  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  50 
 
 
925 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  33.1 
 
 
964 aa  59.7  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
910 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 
178 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 
178 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  36.94 
 
 
916 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.72 
 
 
923 aa  58.9  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 
960 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 
925 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 
211 aa  58.5  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.55 
 
 
1019 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 
908 aa  58.9  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 
214 aa  58.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.91 
 
 
921 aa  58.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 
941 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  33.12 
 
 
893 aa  58.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 
208 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
950 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
228 aa  58.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.92 
 
 
836 aa  58.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 
562 aa  58.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 
928 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  45.83 
 
 
228 aa  58.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.39 
 
 
907 aa  58.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.33 
 
 
1006 aa  58.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
765 aa  58.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.26 
 
 
1146 aa  58.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  46.43 
 
 
923 aa  58.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 
218 aa  57.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2885  LuxR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
545 aa  57.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.488052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  48.1 
 
 
955 aa  57.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 
951 aa  57.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>