More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3297 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
908 aa  1768    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  39.21 
 
 
925 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
994 aa  449  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  35.36 
 
 
943 aa  415  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
931 aa  349  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  33.82 
 
 
855 aa  337  7.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 
941 aa  255  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 
1074 aa  250  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
1104 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 
974 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  34.98 
 
 
952 aa  98.6  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  33.76 
 
 
948 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 
998 aa  87.8  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  35.18 
 
 
946 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  28.89 
 
 
919 aa  84.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  38.81 
 
 
977 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
877 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  31.34 
 
 
893 aa  72.4  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.78 
 
 
947 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 
960 aa  70.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 
943 aa  71.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 
947 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
881 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
881 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
876 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  32.23 
 
 
932 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.35 
 
 
919 aa  68.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
919 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  33.01 
 
 
919 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  56.86 
 
 
900 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 
919 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  58.93 
 
 
955 aa  64.7  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 
923 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  60.78 
 
 
925 aa  64.7  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  55.36 
 
 
921 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 
927 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
937 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4595  regulatory protein, LuxR  35.27 
 
 
336 aa  63.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.878319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  35.34 
 
 
937 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  51.85 
 
 
919 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  35.34 
 
 
937 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  58.82 
 
 
923 aa  63.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  32 
 
 
189 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 
928 aa  61.6  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 
973 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  56.86 
 
 
934 aa  61.6  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 
929 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  33.49 
 
 
921 aa  61.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
921 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  33.49 
 
 
921 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  25.41 
 
 
1143 aa  60.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  50.85 
 
 
963 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 
270 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  29.95 
 
 
910 aa  59.7  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 
894 aa  59.3  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  54.9 
 
 
961 aa  59.3  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
1000 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 
894 aa  58.9  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  47.37 
 
 
235 aa  58.5  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 
258 aa  58.5  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  28.03 
 
 
940 aa  58.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 
959 aa  58.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 
900 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 
876 aa  57.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  43.75 
 
 
827 aa  57.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 
1052 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
894 aa  57.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
913 aa  57.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  56 
 
 
892 aa  57.8  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 
213 aa  57.4  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 
929 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 
818 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  50 
 
 
940 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.54 
 
 
1146 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
927 aa  57.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
953 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5645  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
215 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 
930 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 
229 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
923 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  25.98 
 
 
998 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  43.48 
 
 
963 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
950 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 
951 aa  56.2  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  49.12 
 
 
936 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  36.36 
 
 
916 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  40.26 
 
 
929 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 
946 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
929 aa  55.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 
893 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
215 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 
938 aa  55.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
224 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.97 
 
 
219 aa  55.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 
918 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 
956 aa  55.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 
431 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.1 
 
 
923 aa  55.1  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
889 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  42.68 
 
 
953 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>