More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02220 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 862 aa  1660    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 998 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  26.23 
 
 		 959 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  31.69 
 
 		 938 aa  68.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  32.15 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 928 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  47.92 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.26 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 217 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 204 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 213 aa  63.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  30.67 
 
 		 893 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.29 
 
 		 923 aa  63.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 213 aa  63.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 215 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 206 aa  62.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2188  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.67 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.546074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  44.72 
 
 		 916 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  60 
 
 		 864 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 227 aa  62.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 223 aa  62.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  63.46 
 
 		 937 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.45 
 
 		 222 aa  62  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 		 214 aa  62  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  47.92 
 
 		 567 aa  62  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 229 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35 
 
 		 917 aa  61.6  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.41 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 927 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 970 aa  61.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  47.22 
 
 		 221 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.53 
 
 		 207 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  40.43 
 
 		 967 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2829  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 865 aa  60.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 981 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  57.41 
 
 		 205 aa  60.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.34 
 
 		 222 aa  60.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  38.97 
 
 		 1006 aa  60.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 207 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 818 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  25.13 
 
 		 1183 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 953 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 203 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  52.54 
 
 		 217 aa  60.1  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 235 aa  60.1  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 250 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 231 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 231 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 211 aa  60.1  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 1084 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 222 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 245 aa  59.3  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  35.04 
 
 		 922 aa  59.3  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 881 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  29.18 
 
 		 956 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.55 
 
 		 223 aa  59.3  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50 
 
 		 226 aa  59.3  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 881 aa  59.7  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 876 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  57.89 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.38 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  50 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  54.55 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  57.89 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.67 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  32.19 
 
 		 923 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.84 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 882 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>