More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2427 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  93.47 
 
 		 245 aa  461  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  78.86 
 
 		 242 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  78.86 
 
 		 242 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  77.24 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  83.48 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  76.55 
 
 		 242 aa  356  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  75.66 
 
 		 242 aa  354  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  75.66 
 
 		 242 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  73.45 
 
 		 242 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.39 
 
 		 226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  60.62 
 
 		 231 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  59.29 
 
 		 231 aa  265  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.54 
 
 		 231 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.54 
 
 		 231 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 216 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 216 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 227 aa  169  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 225 aa  168  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 212 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.95 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  37.72 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  36.4 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  44.36 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  44.59 
 
 		 403 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.79 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  44.53 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.97 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 204 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  42.97 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  42.19 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  42.19 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  42.19 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  48.39 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  48.39 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.18 
 
 		 354 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  43.9 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.5 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.9 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  36.81 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  43.9 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  36.46 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.8 
 
 		 236 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  33.9 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  33.9 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.06 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  36.32 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.16 
 
 		 1156 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.48 
 
 		 1131 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 242 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.15 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  42.28 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  41.91 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.88 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  33.52 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  34.86 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>