More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2955 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  79.65 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  79.65 
 
 		 231 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  72.12 
 
 		 233 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.58 
 
 		 226 aa  317  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  65.65 
 
 		 231 aa  315  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  66.09 
 
 		 231 aa  314  7e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  63.88 
 
 		 235 aa  294  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  55.56 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  55.17 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  53.56 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  53.16 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  52.3 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  52.56 
 
 		 242 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  54.82 
 
 		 233 aa  224  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.09 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 223 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 223 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.11 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 227 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.7 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.7 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 212 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 225 aa  165  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 217 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  36.96 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  35.5 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.16 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  43.41 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.43 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  31.31 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  39.5 
 
 		 170 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.64 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.72 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.87 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  39.85 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  32.16 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  34.23 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  32.24 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  35.37 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  40.29 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  34.81 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.86 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  40.62 
 
 		 326 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  40.58 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.97 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  36.81 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  36.96 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  40.91 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  34.84 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  30.74 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.2 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  31.74 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.31 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  31.58 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  41.22 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  43.55 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.74 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  43.55 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  43.55 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  29.78 
 
 		 269 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  31.58 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  39.53 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.27 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.27 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  39.53 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 1002 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.78 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  39.62 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  38.52 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  43.55 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.8 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  43.55 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 390 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.27 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>