More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1812 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  79.65 
 
 
231 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  70.93 
 
 
233 aa  330  8e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.09 
 
 
226 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  67.69 
 
 
231 aa  320  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  65.5 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  63 
 
 
235 aa  305  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  54.98 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  54.98 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  53.1 
 
 
245 aa  241  6e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  53.54 
 
 
245 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  53.98 
 
 
242 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  53.68 
 
 
242 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  53.51 
 
 
242 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
242 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  51.93 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  50.88 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.25 
 
 
221 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
245 aa  189  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.3 
 
 
223 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.3 
 
 
223 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.32 
 
 
229 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
227 aa  182  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 
216 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 
216 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.86 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
225 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.77 
 
 
217 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 
212 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
215 aa  164  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 
230 aa  161  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  35.9 
 
 
319 aa  153  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  36.32 
 
 
222 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 
226 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  40.83 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  39.24 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.57 
 
 
251 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 
255 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  29.06 
 
 
237 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  38.85 
 
 
228 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 
224 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  38.85 
 
 
254 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  38.85 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  38.22 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  38.85 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 
262 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  38.61 
 
 
225 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.36 
 
 
227 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  38.61 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  38.61 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  33.04 
 
 
239 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 
243 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  38.61 
 
 
225 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 
238 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.06 
 
 
237 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.06 
 
 
237 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.44 
 
 
233 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  40.46 
 
 
259 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 
235 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 
234 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 
221 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  29.36 
 
 
235 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.42 
 
 
239 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  41.54 
 
 
237 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  42.86 
 
 
268 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  34.95 
 
 
229 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 
249 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.63 
 
 
326 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  40.46 
 
 
257 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
219 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 
240 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.73 
 
 
232 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  44.63 
 
 
326 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.84 
 
 
236 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.47 
 
 
236 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  29.44 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  37.22 
 
 
243 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 
229 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 
231 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  40.14 
 
 
403 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  37.85 
 
 
228 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
1002 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
216 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 
231 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0373  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 
246 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.69 
 
 
246 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>