More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2311 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 922 aa  1791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  42.74 
 
 		 961 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  41.68 
 
 		 955 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  41.55 
 
 		 934 aa  482  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  40.34 
 
 		 923 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 927 aa  331  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  33.04 
 
 		 919 aa  287  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 929 aa  268  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 923 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 911 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 928 aa  225  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  38.69 
 
 		 928 aa  221  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  37.58 
 
 		 909 aa  221  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  42.34 
 
 		 884 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  40.22 
 
 		 920 aa  215  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  40.15 
 
 		 928 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 995 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  39.82 
 
 		 892 aa  204  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 923 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  36.19 
 
 		 930 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  38.77 
 
 		 918 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  38.67 
 
 		 904 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  39.43 
 
 		 929 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 950 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 919 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.7 
 
 		 913 aa  173  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 905 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  38.34 
 
 		 903 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 936 aa  161  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 894 aa  161  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 937 aa  161  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  35.4 
 
 		 937 aa  161  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  35.4 
 
 		 937 aa  161  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 927 aa  160  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  33.48 
 
 		 917 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.15 
 
 		 913 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 1064 aa  148  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 		 916 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  36.83 
 
 		 910 aa  141  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.32 
 
 		 923 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  37.17 
 
 		 884 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 938 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  31.46 
 
 		 919 aa  128  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  35.46 
 
 		 997 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  34.68 
 
 		 921 aa  124  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  33.24 
 
 		 900 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  40.49 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 		 916 aa  119  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.34 
 
 		 929 aa  118  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 915 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.57 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.57 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  28.1 
 
 		 927 aa  104  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 879 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 921 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.88 
 
 		 921 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.59 
 
 		 921 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 876 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 		 954 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 881 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 881 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 889 aa  88.2  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 1000 aa  87.8  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  32.07 
 
 		 966 aa  87.4  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 		 977 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.18 
 
 		 953 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 925 aa  84.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  30.82 
 
 		 947 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.69 
 
 		 940 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 940 aa  81.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.46 
 
 		 1006 aa  81.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  29.39 
 
 		 959 aa  78.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 1030 aa  78.2  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  29.3 
 
 		 1143 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 1015 aa  77  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 973 aa  76.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  25.71 
 
 		 1005 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 1297 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 		 1037 aa  74.7  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  29.34 
 
 		 956 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.47 
 
 		 1029 aa  73.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 992 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 967 aa  72  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 894 aa  71.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  29.81 
 
 		 1052 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8281  hypothetical protein  37.7 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0961782  normal  0.672711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  27.66 
 
 		 1123 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.45 
 
 		 1080 aa  70.1  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 946 aa  69.3  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 881 aa  68.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.3 
 
 		 1227 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.24 
 
 		 1081 aa  67  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 913 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  29.45 
 
 		 932 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.53 
 
 		 1087 aa  67  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 		 938 aa  66.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.22 
 
 		 1358 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.57 
 
 		 1029 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>