More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0265 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
946 aa  1805    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  42.37 
 
 
884 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 
909 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 
928 aa  475  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  39.67 
 
 
919 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.37 
 
 
925 aa  357  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 
920 aa  343  5.999999999999999e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 
928 aa  329  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  35.56 
 
 
929 aa  318  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 
940 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.67 
 
 
923 aa  304  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.69 
 
 
913 aa  298  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 
903 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 
938 aa  294  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 
905 aa  292  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.35 
 
 
879 aa  275  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  44.5 
 
 
930 aa  274  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 
913 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 
911 aa  263  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  43.97 
 
 
928 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  45.58 
 
 
940 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  44.99 
 
 
937 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  44.99 
 
 
937 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  44.76 
 
 
937 aa  237  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
950 aa  235  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 
894 aa  234  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  44.47 
 
 
919 aa  230  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  39.43 
 
 
927 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  44.71 
 
 
936 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  44.06 
 
 
910 aa  203  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.49 
 
 
923 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  40.48 
 
 
892 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.12 
 
 
955 aa  185  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36.6 
 
 
923 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.35 
 
 
917 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 
953 aa  180  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
889 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  40.9 
 
 
929 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.01 
 
 
884 aa  169  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  38.29 
 
 
927 aa  163  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  35.7 
 
 
934 aa  161  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 
923 aa  145  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  42.6 
 
 
240 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 
1064 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  36.11 
 
 
913 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  42.42 
 
 
961 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  36.9 
 
 
915 aa  121  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 
995 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  29.04 
 
 
927 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 
916 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 
916 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  55.08 
 
 
918 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 
835 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
919 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  29.81 
 
 
919 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  29.81 
 
 
919 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  33.06 
 
 
921 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  46.97 
 
 
921 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
921 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  46.21 
 
 
921 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  46.33 
 
 
904 aa  92.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  43.9 
 
 
977 aa  92  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 
997 aa  87.8  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
1000 aa  87.4  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  37.85 
 
 
893 aa  86.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 
940 aa  85.1  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 
954 aa  84.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 
897 aa  82.8  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  31.42 
 
 
919 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  46.34 
 
 
929 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 
894 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
881 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
881 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
876 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.35 
 
 
1075 aa  74.7  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 
946 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
910 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.36 
 
 
922 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
189 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
877 aa  72  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
998 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 
992 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 
947 aa  68.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 
959 aa  67.4  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.59 
 
 
1422 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
541 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 
953 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 
956 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 
952 aa  65.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 
960 aa  64.7  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  28.85 
 
 
1289 aa  63.9  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  38.17 
 
 
974 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  43.88 
 
 
952 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 
937 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
236 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 
956 aa  63.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 
1085 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 
876 aa  62  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  34.2 
 
 
309 aa  62  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
900 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>