More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0566 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
919 aa  1800    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
919 aa  1800    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  99.46 
 
 
919 aa  1792    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  44.82 
 
 
921 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  44.82 
 
 
921 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  44.6 
 
 
921 aa  602  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  44.85 
 
 
929 aa  590  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  43.53 
 
 
921 aa  568  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  43.67 
 
 
919 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  45.08 
 
 
900 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.24 
 
 
977 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  31.38 
 
 
923 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 
916 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 
925 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  33.33 
 
 
928 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 
997 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  31.98 
 
 
892 aa  124  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  32.15 
 
 
919 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  29.34 
 
 
879 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  29.03 
 
 
995 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  29.82 
 
 
916 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.57 
 
 
922 aa  115  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.9 
 
 
955 aa  115  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  31.69 
 
 
953 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.52 
 
 
923 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  32.86 
 
 
913 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  34.84 
 
 
913 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  32.6 
 
 
884 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  37.12 
 
 
913 aa  111  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 
910 aa  109  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 
940 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  31.14 
 
 
930 aa  108  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  27.02 
 
 
923 aa  108  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  32.25 
 
 
928 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 
927 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 
918 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  26.55 
 
 
959 aa  103  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.78 
 
 
927 aa  102  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 
897 aa  101  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  29.62 
 
 
934 aa  99.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  30.75 
 
 
929 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  35.68 
 
 
884 aa  98.2  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
889 aa  97.8  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 
909 aa  97.8  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 
910 aa  94  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 
904 aa  94.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  29.17 
 
 
923 aa  93.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 
905 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 
915 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  23.97 
 
 
893 aa  92.8  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  38 
 
 
917 aa  92  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  32.41 
 
 
929 aa  91.7  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.48 
 
 
1006 aa  89.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  29.56 
 
 
940 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 
946 aa  88.6  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
937 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  31.17 
 
 
937 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  29.84 
 
 
918 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  30.92 
 
 
937 aa  84.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 
938 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  30.02 
 
 
950 aa  84  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
881 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
881 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
876 aa  84.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  24.02 
 
 
943 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  29.37 
 
 
961 aa  82  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 
920 aa  82  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  31.39 
 
 
894 aa  82  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  34.01 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.13 
 
 
894 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 
1052 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.49 
 
 
1146 aa  78.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 
927 aa  78.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 
992 aa  77.8  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  26.28 
 
 
911 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  26.05 
 
 
953 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 
954 aa  75.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.22 
 
 
1015 aa  75.1  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 
928 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.21 
 
 
1123 aa  74.7  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  36 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 
966 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
903 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  32.92 
 
 
998 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 
919 aa  72.4  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.53 
 
 
1118 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
974 aa  71.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  56.45 
 
 
855 aa  70.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 
951 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.63 
 
 
1117 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 
973 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  30.32 
 
 
1064 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
877 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 
1644 aa  70.1  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  27.43 
 
 
758 aa  69.7  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.68 
 
 
1029 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  26.65 
 
 
973 aa  68.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  26.81 
 
 
1075 aa  67.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 
932 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 
998 aa  67.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>