More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1214 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 937 aa  998    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  63.05 
 
 		 937 aa  998    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 930 aa  1834    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  64.25 
 
 		 940 aa  988    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  62.73 
 
 		 937 aa  993    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  46.78 
 
 		 929 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  45.89 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  45.94 
 
 		 905 aa  584  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  45.99 
 
 		 903 aa  585  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 936 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 918 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  45.88 
 
 		 919 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.81 
 
 		 894 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 950 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  39.36 
 
 		 925 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 923 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  35.83 
 
 		 909 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  37.13 
 
 		 884 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  36.62 
 
 		 919 aa  353  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 		 928 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  33.4 
 
 		 911 aa  323  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 927 aa  301  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  37 
 
 		 913 aa  290  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  33.57 
 
 		 961 aa  277  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  33.47 
 
 		 940 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  43.88 
 
 		 946 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 928 aa  245  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 927 aa  244  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  32.22 
 
 		 913 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.57 
 
 		 879 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 920 aa  219  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  40.39 
 
 		 913 aa  210  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  35.23 
 
 		 955 aa  204  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  35.71 
 
 		 922 aa  203  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.45 
 
 		 923 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  42.3 
 
 		 892 aa  197  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 929 aa  196  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  41.98 
 
 		 884 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  37.39 
 
 		 934 aa  193  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 923 aa  191  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.5 
 
 		 938 aa  186  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 953 aa  184  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  49.09 
 
 		 240 aa  183  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 889 aa  178  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 910 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.21 
 
 		 917 aa  153  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.99 
 
 		 995 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.4 
 
 		 1064 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  41.09 
 
 		 923 aa  118  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.49 
 
 		 916 aa  114  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.29 
 
 		 927 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 919 aa  109  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.95 
 
 		 919 aa  109  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.95 
 
 		 919 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.13 
 
 		 915 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 876 aa  101  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 881 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 881 aa  101  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.23 
 
 		 919 aa  97.4  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  33.5 
 
 		 893 aa  96.3  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 916 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 998 aa  95.1  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 897 aa  93.2  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  48.74 
 
 		 904 aa  92.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 189 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  40.11 
 
 		 959 aa  89.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.96 
 
 		 921 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 894 aa  89  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.33 
 
 		 921 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.15 
 
 		 921 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 951 aa  86.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 910 aa  84.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 946 aa  82.4  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 1000 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.2 
 
 		 977 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  28.94 
 
 		 997 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  32.6 
 
 		 835 aa  78.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.91 
 
 		 929 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 974 aa  75.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.11 
 
 		 1160 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 1015 aa  73.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 953 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 877 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.61 
 
 		 1190 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 998 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.48 
 
 		 1150 aa  68.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 		 948 aa  68.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 907 aa  68.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 947 aa  67.8  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 981 aa  66.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 932 aa  65.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.61 
 
 		 981 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 960 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 940 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 956 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 1137 aa  63.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  28.23 
 
 		 872 aa  62.4  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>