More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0281 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
947 aa  1816    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  38.91 
 
 
952 aa  334  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 
948 aa  325  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  41.26 
 
 
855 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 
998 aa  302  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 
932 aa  236  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 
943 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 
960 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 
974 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 
951 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 
946 aa  196  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  35.01 
 
 
940 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  30.41 
 
 
925 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  29.2 
 
 
943 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
877 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 
900 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.15 
 
 
894 aa  96.3  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.37 
 
 
1118 aa  92.8  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 
956 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.62 
 
 
1015 aa  91.7  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 
1022 aa  91.3  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.77 
 
 
1029 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.47 
 
 
1198 aa  89  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
1403 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
994 aa  87.8  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.18 
 
 
1150 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  29.68 
 
 
1054 aa  85.1  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  40 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  29.64 
 
 
919 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
881 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
881 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  32.02 
 
 
939 aa  83.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
876 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.28 
 
 
1146 aa  81.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  29.72 
 
 
723 aa  81.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.07 
 
 
1141 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.07 
 
 
1141 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 
1105 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
973 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 
938 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  24.43 
 
 
1712 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  30.83 
 
 
928 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.81 
 
 
947 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  28.99 
 
 
855 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 
927 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.51 
 
 
1116 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 
928 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  29.64 
 
 
963 aa  78.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.73 
 
 
1075 aa  77.4  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  37.3 
 
 
913 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 
894 aa  77  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 
910 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 
910 aa  76.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  27.61 
 
 
1141 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  29.72 
 
 
922 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  30.5 
 
 
892 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 
940 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
889 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.42 
 
 
1067 aa  76.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.56 
 
 
919 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 
1084 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  27.13 
 
 
1020 aa  75.5  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 
923 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  30.86 
 
 
923 aa  75.1  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  37.78 
 
 
893 aa  75.1  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  22.65 
 
 
2279 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 
928 aa  74.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 
937 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 
904 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  36 
 
 
937 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  36 
 
 
937 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 
981 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  28.39 
 
 
966 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 
1013 aa  73.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.55 
 
 
1148 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  22.9 
 
 
2272 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  37.59 
 
 
903 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.28 
 
 
967 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.49 
 
 
1109 aa  73.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
1000 aa  72.8  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  29.18 
 
 
956 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  36.55 
 
 
925 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  26.52 
 
 
1055 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  24.87 
 
 
1160 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.72 
 
 
1139 aa  72.4  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  29.77 
 
 
1121 aa  71.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
895 aa  71.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  25.86 
 
 
993 aa  71.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
1235 aa  71.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  21.59 
 
 
2303 aa  71.2  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 
911 aa  70.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.34 
 
 
955 aa  70.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  29.36 
 
 
1071 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.8 
 
 
917 aa  70.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  30.15 
 
 
931 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  21.4 
 
 
1093 aa  70.1  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  45.97 
 
 
913 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 
927 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  26.89 
 
 
953 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.36 
 
 
1193 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>