More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2467 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 915 aa  1666    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  47.07 
 
 		 913 aa  511  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.45 
 
 		 919 aa  300  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 928 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  35.73 
 
 		 884 aa  258  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 911 aa  253  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 909 aa  251  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  34.46 
 
 		 925 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.83 
 
 		 928 aa  245  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 923 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  35.6 
 
 		 940 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  31.92 
 
 		 927 aa  218  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.67 
 
 		 910 aa  216  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  34.49 
 
 		 913 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 916 aa  211  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  35.91 
 
 		 938 aa  210  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  33.26 
 
 		 905 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 937 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 		 937 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  38.22 
 
 		 913 aa  191  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  33.76 
 
 		 919 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  42.75 
 
 		 904 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.44 
 
 		 879 aa  175  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  31.91 
 
 		 929 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  38.66 
 
 		 922 aa  167  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40.21 
 
 		 955 aa  167  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.64 
 
 		 928 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  31.81 
 
 		 900 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 		 995 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  33.62 
 
 		 917 aa  159  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 919 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  40.14 
 
 		 918 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.03 
 
 		 919 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  35.75 
 
 		 930 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.13 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 936 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  29.84 
 
 		 919 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 946 aa  157  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.62 
 
 		 940 aa  157  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  32.55 
 
 		 920 aa  156  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 950 aa  154  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.6 
 
 		 921 aa  153  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  40.05 
 
 		 934 aa  152  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  39.8 
 
 		 884 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  40.29 
 
 		 892 aa  145  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36.16 
 
 		 923 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 921 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.61 
 
 		 921 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.72 
 
 		 921 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 		 894 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 903 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  35.25 
 
 		 923 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 927 aa  132  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.59 
 
 		 937 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 929 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 889 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.02 
 
 		 927 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 916 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  42.22 
 
 		 240 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  33.72 
 
 		 977 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 1064 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  35.25 
 
 		 929 aa  108  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  31.79 
 
 		 919 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.95 
 
 		 998 aa  94.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.71 
 
 		 910 aa  86.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  34.82 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 951 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 953 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 897 aa  76.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  39.69 
 
 		 894 aa  75.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 835 aa  74.7  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 997 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 959 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  32.07 
 
 		 1143 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 544 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 544 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 544 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  33.69 
 
 		 893 aa  68.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  36.36 
 
 		 961 aa  68.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 189 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.23 
 
 		 1023 aa  65.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.02 
 
 		 1227 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.25 
 
 		 1146 aa  65.1  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 946 aa  65.1  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  30.35 
 
 		 953 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 983 aa  64.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 1000 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 		 918 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 998 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  31.42 
 
 		 1043 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 1052 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 786 aa  60.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 		 1050 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.25 
 
 		 1050 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 1398 aa  60.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25 
 
 		 1175 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 932 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1927  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 535 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>