More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1046 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1143 aa  2251    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  43.01 
 
 		 1083 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 648 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  42.97 
 
 		 647 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  42.53 
 
 		 647 aa  370  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  34.82 
 
 		 1163 aa  279  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.99 
 
 		 1029 aa  215  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.92 
 
 		 1139 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.13 
 
 		 1055 aa  172  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.85 
 
 		 1067 aa  157  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 1089 aa  153  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.87 
 
 		 1013 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.35 
 
 		 1034 aa  138  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 494 aa  137  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.83 
 
 		 1126 aa  132  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.82 
 
 		 713 aa  130  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 1190 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 1193 aa  115  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.08 
 
 		 1075 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.24 
 
 		 1141 aa  108  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 1064 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  27.23 
 
 		 1109 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.5 
 
 		 1044 aa  102  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 1141 aa  102  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 1141 aa  102  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 1116 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.05 
 
 		 1183 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 1141 aa  97.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.1 
 
 		 1118 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.1 
 
 		 1118 aa  96.3  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  32.95 
 
 		 992 aa  94.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 1148 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 1050 aa  92.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.66 
 
 		 1175 aa  91.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 		 1145 aa  89.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 973 aa  84.7  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 1151 aa  84.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.99 
 
 		 967 aa  83.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.66 
 
 		 1666 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 1015 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 		 1235 aa  80.5  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 1216 aa  80.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 1007 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.71 
 
 		 1131 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.58 
 
 		 1403 aa  78.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  21.43 
 
 		 1826 aa  77.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.32 
 
 		 900 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  25.84 
 
 		 1056 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  27.49 
 
 		 1029 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.09 
 
 		 1055 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.68 
 
 		 1141 aa  74.7  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  30.16 
 
 		 996 aa  74.7  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 1118 aa  73.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  28.16 
 
 		 1071 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  22.68 
 
 		 1123 aa  73.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 636 aa  72.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  28.77 
 
 		 1051 aa  71.6  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.97 
 
 		 572 aa  71.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  28.38 
 
 		 922 aa  71.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.38 
 
 		 999 aa  70.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.54 
 
 		 1429 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 1020 aa  70.1  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.01 
 
 		 1081 aa  69.7  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.75 
 
 		 1295 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.21 
 
 		 1122 aa  69.3  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  24.81 
 
 		 916 aa  69.3  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 1198 aa  68.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.15 
 
 		 1006 aa  68.6  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.2 
 
 		 1063 aa  68.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.27 
 
 		 1117 aa  68.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  26.94 
 
 		 983 aa  68.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  29.28 
 
 		 1083 aa  68.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.49 
 
 		 1360 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  27.14 
 
 		 1064 aa  67.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.39 
 
 		 1291 aa  67.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  32.48 
 
 		 270 aa  67.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.98 
 
 		 1805 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 1217 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  28.24 
 
 		 1055 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.2 
 
 		 1422 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.78 
 
 		 1441 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.2 
 
 		 1264 aa  66.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 1403 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 1192 aa  66.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.54 
 
 		 1795 aa  65.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  30.95 
 
 		 1061 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 1398 aa  65.5  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.01 
 
 		 957 aa  65.1  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.41 
 
 		 1149 aa  65.1  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 773 aa  65.1  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.31 
 
 		 1080 aa  65.1  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.11 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  27.73 
 
 		 1204 aa  65.1  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.95 
 
 		 1663 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  30.87 
 
 		 963 aa  64.7  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.54 
 
 		 2017 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 1422 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.4 
 
 		 991 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 1340 aa  64.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>