118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2653 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  64.47 
 
 		 561 aa  699    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 572 aa  1154    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 775 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  31.1 
 
 		 1108 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  30.43 
 
 		 1097 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  32.66 
 
 		 999 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 1116 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  29.8 
 
 		 1095 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  30.59 
 
 		 1094 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  30.31 
 
 		 1083 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  32.75 
 
 		 1109 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 309 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  33.08 
 
 		 1118 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  33.08 
 
 		 1118 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28.36 
 
 		 1204 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  28.84 
 
 		 1145 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.65 
 
 		 1163 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 349 aa  97.8  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.23 
 
 		 1126 aa  94  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  29.96 
 
 		 661 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.57 
 
 		 1056 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 423 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.17 
 
 		 1111 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  28.75 
 
 		 1061 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 1064 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 1050 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 1190 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  27.8 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  25.87 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.95 
 
 		 1193 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  25.97 
 
 		 867 aa  77.4  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  27.48 
 
 		 242 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  23.6 
 
 		 1055 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  24.81 
 
 		 376 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  27.95 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3491  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.51 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  28.97 
 
 		 1067 aa  73.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  26.43 
 
 		 1018 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  28.8 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  25.74 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.61 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  27.38 
 
 		 1044 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.7 
 
 		 1029 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  25.97 
 
 		 991 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  28.97 
 
 		 1143 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 1217 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  25.32 
 
 		 689 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.03 
 
 		 1139 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  24.28 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.02 
 
 		 992 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  20.43 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  31.17 
 
 		 1119 aa  64.7  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2121  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.41 
 
 		 333 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  25.33 
 
 		 990 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.36 
 
 		 1075 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  25.66 
 
 		 1055 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.41 
 
 		 1145 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  24.06 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  21.85 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  26.47 
 
 		 925 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  26.39 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  22.08 
 
 		 1082 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 1089 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  24.51 
 
 		 1025 aa  57  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  24.12 
 
 		 312 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.79 
 
 		 1034 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  28.76 
 
 		 1064 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1055 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  27.03 
 
 		 993 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  25.2 
 
 		 1013 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  25 
 
 		 1733 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  26.2 
 
 		 914 aa  53.9  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 968 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  29.18 
 
 		 1101 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  22.98 
 
 		 1148 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  25.23 
 
 		 1020 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  34.65 
 
 		 261 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 1216 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.32 
 
 		 1183 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 621 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  24.68 
 
 		 549 aa  50.8  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  24.54 
 
 		 1022 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  23.15 
 
 		 631 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 647 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 1048 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  25.34 
 
 		 985 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  23.6 
 
 		 965 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  22.17 
 
 		 349 aa  48.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  24.68 
 
 		 919 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  22.35 
 
 		 990 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  23.51 
 
 		 446 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  24.5 
 
 		 1141 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  33.96 
 
 		 1068 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  25 
 
 		 1339 aa  47  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>