89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2470 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  42.04 
 
 		 435 aa  208  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 1193 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 1190 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.48 
 
 		 572 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.42 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.98 
 
 		 561 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  24.14 
 
 		 1097 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  26.07 
 
 		 1204 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.03 
 
 		 1095 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  25.11 
 
 		 1145 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  26.43 
 
 		 1094 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.5 
 
 		 999 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 343 aa  62  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  28.28 
 
 		 1093 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  25 
 
 		 1083 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  24.36 
 
 		 1055 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  25.1 
 
 		 1061 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 1064 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  23.48 
 
 		 1109 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  24.79 
 
 		 1108 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  23.91 
 
 		 1163 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  21.68 
 
 		 597 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  23.21 
 
 		 428 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  26.24 
 
 		 1092 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  22.82 
 
 		 597 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 		 378 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  24.2 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  27.7 
 
 		 1049 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  24.56 
 
 		 689 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 602 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  25.82 
 
 		 921 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  22.82 
 
 		 962 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  20.44 
 
 		 1071 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  23.72 
 
 		 1022 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  23.38 
 
 		 1145 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  24.12 
 
 		 1072 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 621 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 309 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 349 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  25.94 
 
 		 661 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  23.21 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  21.74 
 
 		 1017 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  24.68 
 
 		 1158 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 1055 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 349 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  22.27 
 
 		 376 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  23.39 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 621 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  23.81 
 
 		 365 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 622 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  23.04 
 
 		 1102 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  21.83 
 
 		 1118 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  21.83 
 
 		 1118 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 1116 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 1043 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  24.76 
 
 		 1100 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  23.71 
 
 		 908 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  24.45 
 
 		 1044 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.07 
 
 		 631 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  26.05 
 
 		 992 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  24.22 
 
 		 1186 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  22.22 
 
 		 1042 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  23.98 
 
 		 1055 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 1071 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  24.41 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  22.13 
 
 		 1082 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 423 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  24.42 
 
 		 1033 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  23.19 
 
 		 982 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  22.88 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  20.78 
 
 		 1103 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  22.54 
 
 		 1056 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  20.64 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  21.54 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.39 
 
 		 1111 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  23.38 
 
 		 1010 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  23.08 
 
 		 1058 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  22.94 
 
 		 1125 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  21.92 
 
 		 376 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  26.6 
 
 		 910 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  23.21 
 
 		 1075 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  28.79 
 
 		 1031 aa  42  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  25.81 
 
 		 1150 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  24.34 
 
 		 494 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>