54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1624 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  87.97 
 
 		 349 aa  647    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 349 aa  712    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  30.08 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.89 
 
 		 572 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  24.4 
 
 		 561 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.63 
 
 		 1111 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  24.75 
 
 		 689 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  24.58 
 
 		 1163 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  23.73 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.68 
 
 		 999 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 423 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  24.79 
 
 		 1083 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1812  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  30.13 
 
 		 252 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  22.36 
 
 		 1108 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  23.11 
 
 		 1094 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  21.85 
 
 		 1095 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  22.47 
 
 		 1064 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 636 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.79 
 
 		 831 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  25.44 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  25.51 
 
 		 1055 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  25.7 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1055 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  21.52 
 
 		 1204 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  23.94 
 
 		 549 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 210 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  20.75 
 
 		 1018 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  22.92 
 
 		 1193 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3491  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  22.98 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 775 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  23.11 
 
 		 1034 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  19.55 
 
 		 661 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  22.78 
 
 		 1145 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  24.54 
 
 		 242 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  23.75 
 
 		 1029 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  23.75 
 
 		 1013 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1291  transcriptional regulator, SARP family  21.72 
 
 		 1011 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.475725 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2883  response regulator receiver and SARP domain protein  22.34 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000114352  decreased coverage  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24290  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  21.74 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  20.38 
 
 		 1109 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  20.94 
 
 		 1055 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.12 
 
 		 631 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 212 aa  46.2  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 647 aa  46.2  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  20.35 
 
 		 985 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 1050 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  22.82 
 
 		 494 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  21.43 
 
 		 1097 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  18.94 
 
 		 1116 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  19.05 
 
 		 981 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  23.14 
 
 		 252 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6761  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  22.41 
 
 		 735 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  24.22 
 
 		 925 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>