203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5465 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 775 aa  1489    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.9 
 
 		 561 aa  151  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.87 
 
 		 572 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  34.38 
 
 		 1097 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  33.07 
 
 		 1204 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  32.68 
 
 		 1108 aa  104  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1190 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  31.25 
 
 		 1095 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.08 
 
 		 999 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  30.28 
 
 		 1163 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 494 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 309 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 1064 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  31.64 
 
 		 1094 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  30.31 
 
 		 1083 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 1193 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  33.33 
 
 		 1044 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  31.47 
 
 		 268 aa  94.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  31.73 
 
 		 1145 aa  94  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.25 
 
 		 1126 aa  88.6  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.66 
 
 		 1030 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  31.05 
 
 		 1018 aa  87.4  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  30.99 
 
 		 300 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  30.45 
 
 		 1009 aa  85.1  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  31.92 
 
 		 597 aa  84  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 1116 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 654 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  33.16 
 
 		 661 aa  81.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.07 
 
 		 1109 aa  80.9  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  33.04 
 
 		 1118 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  33.04 
 
 		 1118 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  27.53 
 
 		 1111 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  24.49 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 957 aa  77  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 378 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 621 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  25.3 
 
 		 1055 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  27.5 
 
 		 985 aa  75.5  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 1000 aa  74.7  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.56 
 
 		 919 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 1050 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  28.91 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1125 aa  70.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  32.03 
 
 		 1119 aa  70.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 965 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.6 
 
 		 1043 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 		 1093 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  29.9 
 
 		 935 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  31.85 
 
 		 1033 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  27.23 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  31.35 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.38 
 
 		 1067 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  27.27 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  30.43 
 
 		 833 aa  68.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 1108 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  31.05 
 
 		 993 aa  67.8  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  27.66 
 
 		 1145 aa  67.8  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  29.03 
 
 		 1733 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  29.79 
 
 		 1025 aa  67.4  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  25.41 
 
 		 535 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.71 
 
 		 1075 aa  65.1  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 1021 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  31.6 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.89 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 1004 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.31 
 
 		 969 aa  64.3  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.8 
 
 		 1034 aa  64.3  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 210 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  35 
 
 		 1183 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  28.4 
 
 		 946 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  27.38 
 
 		 934 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.11 
 
 		 1090 aa  62  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  32.38 
 
 		 1028 aa  61.6  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.53 
 
 		 1339 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.98 
 
 		 1011 aa  61.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  28.76 
 
 		 990 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  28.73 
 
 		 914 aa  60.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.68 
 
 		 992 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 1161 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  29.81 
 
 		 385 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 262 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 926 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  32.39 
 
 		 1049 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  26.38 
 
 		 1139 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 993 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  30.52 
 
 		 925 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 622 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 1010 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  30.92 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  27.72 
 
 		 1056 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  27.6 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  28.31 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  28.45 
 
 		 1068 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  22.18 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.24 
 
 		 1123 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>