112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4892 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 597 aa  1186    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  35.27 
 
 		 999 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  39.53 
 
 		 1119 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  37.3 
 
 		 1109 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 1116 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  34.88 
 
 		 1118 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  34.88 
 
 		 1118 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  32.93 
 
 		 1204 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.09 
 
 		 1111 aa  100  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  31.33 
 
 		 1145 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  32.8 
 
 		 1067 aa  90.5  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 1064 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  32.26 
 
 		 1055 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  32.03 
 
 		 1163 aa  84.3  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 1193 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.06 
 
 		 1097 aa  84  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 775 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  29.25 
 
 		 1108 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  28.63 
 
 		 1083 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.8 
 
 		 572 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  27.46 
 
 		 1094 aa  75.1  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 1190 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  36.59 
 
 		 925 aa  73.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.23 
 
 		 1029 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.05 
 
 		 1061 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  30.2 
 
 		 1013 aa  71.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.27 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.23 
 
 		 1095 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  29.84 
 
 		 1044 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  28.89 
 
 		 661 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  26.29 
 
 		 1000 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  25.4 
 
 		 1071 aa  67  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  30.61 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  24.26 
 
 		 1082 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  32.54 
 
 		 1183 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  26.29 
 
 		 1055 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  27.82 
 
 		 1186 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  26.85 
 
 		 1056 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  26.38 
 
 		 867 aa  61.6  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.21 
 
 		 1126 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  20.73 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  24 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  22.09 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 526 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.26 
 
 		 1100 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  28.63 
 
 		 248 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  31.1 
 
 		 1102 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  21.49 
 
 		 242 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  22.8 
 
 		 831 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.84 
 
 		 1075 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  30.16 
 
 		 1018 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 202 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  26.09 
 
 		 267 aa  54.7  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  28.39 
 
 		 1066 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  30.51 
 
 		 1064 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  25.45 
 
 		 991 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  28.74 
 
 		 1093 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  26.4 
 
 		 911 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 1050 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  21.07 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1291  transcriptional regulator, SARP family  28.07 
 
 		 1011 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.475725 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  27.76 
 
 		 1289 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.71 
 
 		 1034 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  26.91 
 
 		 907 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 261 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  26.95 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 621 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  29.75 
 
 		 244 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 965 aa  51.2  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  36.2 
 
 		 990 aa  51.2  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  28.2 
 
 		 1005 aa  50.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  30.69 
 
 		 1042 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 212 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 993 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  20.16 
 
 		 1055 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  28.29 
 
 		 1058 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  40.85 
 
 		 1064 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  26.19 
 
 		 252 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  28.15 
 
 		 270 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  27.31 
 
 		 1068 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  31.69 
 
 		 1131 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  26.02 
 
 		 535 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  28.3 
 
 		 1102 aa  47.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0014  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.95 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 1217 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  28.39 
 
 		 244 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.29 
 
 		 344 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  25 
 
 		 1216 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  28.63 
 
 		 1070 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  25.31 
 
 		 981 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.15 
 
 		 919 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  27.27 
 
 		 268 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  27.51 
 
 		 370 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>