243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2801 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  48.44 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  46.83 
 
 		 621 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  42.02 
 
 		 631 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  41.2 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  41.96 
 
 		 1000 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  40.23 
 
 		 1022 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  41.5 
 
 		 378 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  38.1 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 833 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.06 
 
 		 934 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.83 
 
 		 960 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.59 
 
 		 981 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.96 
 
 		 950 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.61 
 
 		 1025 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  39.85 
 
 		 992 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  38.62 
 
 		 453 aa  149  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 622 aa  148  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  38.82 
 
 		 1733 aa  148  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 		 1013 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 654 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 1108 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 993 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 1030 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 940 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 1186 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.68 
 
 		 1110 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 1346 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.58 
 
 		 1092 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 995 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 921 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 1014 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 957 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  36.43 
 
 		 965 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 1010 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.92 
 
 		 1102 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.46 
 
 		 1003 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.29 
 
 		 1088 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  37.85 
 
 		 954 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 983 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 990 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 1058 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  39.33 
 
 		 1125 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 1020 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 1319 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 1003 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.88 
 
 		 969 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 1100 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 941 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.47 
 
 		 496 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.85 
 
 		 919 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.45 
 
 		 1055 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 989 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 979 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.46 
 
 		 921 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 1005 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 968 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  36.43 
 
 		 1048 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 1071 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  36.8 
 
 		 992 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.22 
 
 		 1033 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  33.2 
 
 		 1123 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  35.57 
 
 		 1056 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 668 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 489 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3489  SARP family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148382  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 964 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.27 
 
 		 1339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  36.58 
 
 		 1028 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.8 
 
 		 1018 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 982 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 1042 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1118 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 760 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 1161 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.4 
 
 		 1103 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.22 
 
 		 1097 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  35.94 
 
 		 935 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  31.35 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  35.83 
 
 		 908 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 370 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 990 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.08 
 
 		 1072 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 1093 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.89 
 
 		 1058 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.88 
 
 		 926 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 931 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 		 379 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.09 
 
 		 956 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 943 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.86 
 
 		 981 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 1054 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>