115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0404 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1055 aa  2089    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  19.5 
 
 		 1108 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  24.7 
 
 		 1204 aa  85.5  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  20.87 
 
 		 947 aa  84.7  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.6 
 
 		 913 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 914 aa  83.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  28.57 
 
 		 1163 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  25.91 
 
 		 435 aa  80.1  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  21.43 
 
 		 1055 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  20.61 
 
 		 1095 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  22.71 
 
 		 1145 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  21.41 
 
 		 897 aa  79  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  16.62 
 
 		 880 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  18.52 
 
 		 960 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  20.31 
 
 		 913 aa  76.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.49 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  18.51 
 
 		 904 aa  74.7  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.06 
 
 		 947 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  17.38 
 
 		 905 aa  72.8  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.67 
 
 		 925 aa  72.8  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  21.72 
 
 		 1097 aa  72  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.84 
 
 		 930 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  20.52 
 
 		 933 aa  71.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  17.71 
 
 		 1018 aa  70.5  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  20.51 
 
 		 1336 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  18.56 
 
 		 910 aa  70.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.54 
 
 		 867 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  24.83 
 
 		 916 aa  68.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.99 
 
 		 870 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  17.63 
 
 		 921 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  23.88 
 
 		 855 aa  68.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.28 
 
 		 914 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  17.03 
 
 		 921 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  17.03 
 
 		 921 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  20.57 
 
 		 944 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  24.58 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  19.24 
 
 		 947 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  20.13 
 
 		 896 aa  64.3  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  21.74 
 
 		 907 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  18.33 
 
 		 900 aa  63.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  19.13 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  19.91 
 
 		 901 aa  63.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  28.22 
 
 		 215 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  20.27 
 
 		 921 aa  63.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  17.74 
 
 		 919 aa  62.8  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  18.54 
 
 		 876 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  18.09 
 
 		 924 aa  63.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  17.6 
 
 		 766 aa  62.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  23.36 
 
 		 921 aa  62  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  22.62 
 
 		 999 aa  61.6  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  18.6 
 
 		 1025 aa  61.6  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  20.07 
 
 		 924 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  20.05 
 
 		 1111 aa  60.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  20.96 
 
 		 900 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  26.58 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  21.43 
 
 		 906 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  20.06 
 
 		 913 aa  57  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  20.16 
 
 		 884 aa  57  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.69 
 
 		 928 aa  56.2  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  22.04 
 
 		 901 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  22.86 
 
 		 572 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  18.69 
 
 		 1021 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 210 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 349 aa  55.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  17.3 
 
 		 1019 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  17.68 
 
 		 756 aa  54.3  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  20.75 
 
 		 661 aa  54.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  22.22 
 
 		 1083 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  20.35 
 
 		 894 aa  53.5  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  18.22 
 
 		 899 aa  52.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  20.82 
 
 		 561 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  15.79 
 
 		 758 aa  52.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  21.55 
 
 		 907 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  20.94 
 
 		 907 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  20.95 
 
 		 1094 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 349 aa  52.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  22.42 
 
 		 920 aa  52  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 212 aa  51.6  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  16.15 
 
 		 824 aa  51.6  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 1064 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.6 
 
 		 860 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.35 
 
 		 896 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  18.61 
 
 		 888 aa  51.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  20.16 
 
 		 597 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  18.71 
 
 		 878 aa  50.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  18.14 
 
 		 1102 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  20.08 
 
 		 1145 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  19.5 
 
 		 887 aa  50.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  21.53 
 
 		 1075 aa  49.7  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  20.26 
 
 		 1109 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  21.25 
 
 		 985 aa  50.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  19.17 
 
 		 896 aa  49.7  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  17.17 
 
 		 904 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  17.72 
 
 		 901 aa  49.3  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  21.58 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2470  response regulator receiver and SARP domain protein  21.66 
 
 		 242 aa  48.5  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  23.28 
 
 		 1126 aa  48.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  20.6 
 
 		 1101 aa  48.1  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 961 aa  47.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>