201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1222 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  100 
 
 
1018 aa  1960    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  65.38 
 
 
1025 aa  1163    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  35.31 
 
 
1204 aa  131  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  35.43 
 
 
1083 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  33.11 
 
 
1163 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  35.03 
 
 
1145 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  34.28 
 
 
1094 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  32.57 
 
 
1097 aa  114  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  34.25 
 
 
1095 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  31.34 
 
 
1108 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  33.5 
 
 
423 aa  104  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  34.75 
 
 
1064 aa  96.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.16 
 
 
900 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  30.77 
 
 
775 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  32.42 
 
 
1126 aa  85.5  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.56 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  31.79 
 
 
1190 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.21 
 
 
910 aa  79  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.02 
 
 
917 aa  78.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.97 
 
 
1193 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  27.6 
 
 
913 aa  78.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  29.54 
 
 
661 aa  77.4  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.94 
 
 
1111 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  32.31 
 
 
900 aa  77.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.87 
 
 
897 aa  76.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.03 
 
 
572 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.83 
 
 
1067 aa  74.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  24.26 
 
 
887 aa  72.8  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.24 
 
 
880 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.35 
 
 
1021 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.95 
 
 
1029 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.4 
 
 
902 aa  69.7  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.07 
 
 
870 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  32.81 
 
 
1118 aa  68.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.37 
 
 
999 aa  68.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.54 
 
 
884 aa  68.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  23.71 
 
 
921 aa  67.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.4 
 
 
766 aa  67.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  24.7 
 
 
921 aa  67.8  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  26.36 
 
 
904 aa  67.4  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.31 
 
 
1061 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.65 
 
 
902 aa  67  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  27.2 
 
 
913 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  29.97 
 
 
881 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.76 
 
 
1055 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
914 aa  65.1  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.27 
 
 
1109 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09000  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.16 
 
 
831 aa  64.7  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  26.33 
 
 
969 aa  64.7  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  17.71 
 
 
1055 aa  64.3  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.91 
 
 
824 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  25.11 
 
 
901 aa  64.3  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.83 
 
 
889 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
947 aa  63.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  31.73 
 
 
1075 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  27.63 
 
 
376 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  25.45 
 
 
903 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  26.24 
 
 
899 aa  63.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  25.45 
 
 
903 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  30.26 
 
 
1068 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  29.09 
 
 
896 aa  63.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  28.91 
 
 
446 aa  62.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  29.88 
 
 
300 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  25.87 
 
 
944 aa  62.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.21 
 
 
924 aa  62.4  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.74 
 
 
894 aa  62  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1442  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  30.86 
 
 
291 aa  62  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  27.67 
 
 
1055 aa  62  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  29.73 
 
 
449 aa  61.6  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.68 
 
 
922 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.09 
 
 
921 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.09 
 
 
921 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  27.59 
 
 
960 aa  61.6  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.14 
 
 
901 aa  61.2  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.82 
 
 
900 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 
689 aa  60.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.09 
 
 
921 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2176  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.97 
 
 
888 aa  60.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  29.03 
 
 
1733 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6761  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.38 
 
 
735 aa  61.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  30.45 
 
 
900 aa  60.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.74 
 
 
1145 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.82 
 
 
914 aa  60.1  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.7 
 
 
914 aa  60.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  23.44 
 
 
901 aa  60.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  29.95 
 
 
786 aa  60.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  21.86 
 
 
954 aa  59.3  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  27.34 
 
 
905 aa  59.7  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 
270 aa  59.3  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  29.28 
 
 
890 aa  59.3  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.33 
 
 
930 aa  58.9  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.6 
 
 
919 aa  58.9  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  30.81 
 
 
1217 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  31.95 
 
 
1102 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.69 
 
 
930 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  25.34 
 
 
901 aa  58.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  25.34 
 
 
902 aa  58.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  25.34 
 
 
901 aa  58.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  25.34 
 
 
901 aa  58.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  25.34 
 
 
901 aa  58.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>