204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3125 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 		 1068 aa  2137    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2354  transcriptional activator domain-containing protein  75.7 
 
 		 1070 aa  1536    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.607566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 921 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.5 
 
 		 867 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.13 
 
 		 897 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  28.94 
 
 		 900 aa  130  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.05 
 
 		 1108 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.94 
 
 		 901 aa  129  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.37 
 
 		 905 aa  127  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.65 
 
 		 749 aa  126  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.04 
 
 		 910 aa  127  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.22 
 
 		 877 aa  121  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  25.12 
 
 		 914 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 904 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.65 
 
 		 1019 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.07 
 
 		 922 aa  112  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.8 
 
 		 1111 aa  112  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  24.47 
 
 		 902 aa  110  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.95 
 
 		 913 aa  110  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.63 
 
 		 914 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.71 
 
 		 930 aa  108  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27.91 
 
 		 916 aa  108  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  24.46 
 
 		 903 aa  108  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  24.46 
 
 		 903 aa  108  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.11 
 
 		 902 aa  107  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.37 
 
 		 1097 aa  107  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 907 aa  105  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  26.45 
 
 		 1055 aa  105  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  24.29 
 
 		 904 aa  104  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  29.53 
 
 		 913 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  25.05 
 
 		 1110 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 907 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.47 
 
 		 758 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  26.1 
 
 		 921 aa  102  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.64 
 
 		 766 aa  102  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27 
 
 		 876 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.53 
 
 		 919 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.18 
 
 		 924 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.6 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.6 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.29 
 
 		 887 aa  99.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.6 
 
 		 921 aa  99.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  27.21 
 
 		 907 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  27.15 
 
 		 896 aa  99  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.29 
 
 		 1003 aa  99.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.97 
 
 		 917 aa  98.2  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  23.72 
 
 		 1061 aa  97.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  28.05 
 
 		 1071 aa  97.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.9 
 
 		 889 aa  97.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.83 
 
 		 870 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.67 
 
 		 933 aa  95.1  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.6 
 
 		 894 aa  94.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  24.86 
 
 		 901 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  24.86 
 
 		 901 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.86 
 
 		 901 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  24.86 
 
 		 901 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  24.86 
 
 		 901 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  24.86 
 
 		 901 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  24.86 
 
 		 901 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  26.61 
 
 		 756 aa  93.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  24.86 
 
 		 901 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  25.31 
 
 		 1082 aa  93.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  22.24 
 
 		 901 aa  93.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 914 aa  93.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  24.29 
 
 		 901 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  27.32 
 
 		 732 aa  92  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.62 
 
 		 896 aa  92  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  28.28 
 
 		 985 aa  92  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.14 
 
 		 1021 aa  91.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  24.29 
 
 		 902 aa  91.3  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  24.29 
 
 		 901 aa  91.3  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  24.29 
 
 		 901 aa  91.3  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  24.29 
 
 		 901 aa  91.3  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.38 
 
 		 947 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  28.15 
 
 		 913 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  27.43 
 
 		 1145 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  24.22 
 
 		 901 aa  90.1  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.48 
 
 		 730 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.29 
 
 		 880 aa  88.2  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.17 
 
 		 896 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  28.53 
 
 		 1095 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  25.13 
 
 		 1031 aa  85.9  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  26.79 
 
 		 1102 aa  85.1  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  26.51 
 
 		 1204 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  29.75 
 
 		 919 aa  82.4  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0140  ATP-dependent transcriptional regulator  24.39 
 
 		 977 aa  82  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.63 
 
 		 925 aa  82  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.72 
 
 		 932 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  24.16 
 
 		 894 aa  80.9  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  28.97 
 
 		 1009 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  24.26 
 
 		 899 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.37 
 
 		 914 aa  80.1  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2887  transcriptional regulator domain protein  30.28 
 
 		 997 aa  80.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0904649  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.11 
 
 		 881 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3564  MalT  24.14 
 
 		 695 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.534347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  25.79 
 
 		 1000 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 993 aa  76.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  24.8 
 
 		 969 aa  77  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.48 
 
 		 935 aa  75.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  28.65 
 
 		 888 aa  75.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.566011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>