288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3827 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  100 
 
 		 1102 aa  2129    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  36.42 
 
 		 881 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  39.73 
 
 		 990 aa  279  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2887  transcriptional regulator domain protein  40.1 
 
 		 997 aa  278  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0904649  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.88 
 
 		 867 aa  169  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.26 
 
 		 910 aa  157  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.33 
 
 		 876 aa  152  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.08 
 
 		 870 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  42.16 
 
 		 925 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 913 aa  144  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.01 
 
 		 1019 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 921 aa  143  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.56 
 
 		 901 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  33.71 
 
 		 913 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  28.81 
 
 		 1111 aa  139  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27.75 
 
 		 916 aa  139  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.67 
 
 		 766 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  28.53 
 
 		 887 aa  137  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 914 aa  137  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  31.03 
 
 		 914 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  31.87 
 
 		 933 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.26 
 
 		 905 aa  128  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.13 
 
 		 897 aa  127  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.33 
 
 		 914 aa  125  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  31.64 
 
 		 1110 aa  125  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  33.14 
 
 		 921 aa  124  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.24 
 
 		 877 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.5 
 
 		 924 aa  124  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  29.12 
 
 		 910 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.15 
 
 		 947 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  31.45 
 
 		 900 aa  120  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.05 
 
 		 846 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  30.18 
 
 		 896 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.9 
 
 		 878 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  29.29 
 
 		 920 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.42 
 
 		 880 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.79 
 
 		 1003 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 904 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  30.24 
 
 		 904 aa  116  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31 
 
 		 905 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.36 
 
 		 758 aa  114  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.52 
 
 		 913 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.22 
 
 		 917 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  30.46 
 
 		 905 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.56 
 
 		 906 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.13 
 
 		 932 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  27.09 
 
 		 896 aa  112  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  28.12 
 
 		 901 aa  112  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.73 
 
 		 905 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 905 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30 
 
 		 1021 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.82 
 
 		 884 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  27.37 
 
 		 902 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  27.37 
 
 		 901 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  27.37 
 
 		 901 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 906 aa  110  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  27.37 
 
 		 901 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  27.37 
 
 		 901 aa  110  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  31.56 
 
 		 824 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  28.49 
 
 		 903 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.03 
 
 		 922 aa  107  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  28.49 
 
 		 903 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.46 
 
 		 911 aa  107  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.13 
 
 		 930 aa  106  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  31.53 
 
 		 919 aa  104  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  30.07 
 
 		 1145 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.6 
 
 		 901 aa  104  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  33.5 
 
 		 900 aa  104  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  30.81 
 
 		 1204 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.6 
 
 		 901 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.39 
 
 		 1108 aa  103  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 		 1336 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.6 
 
 		 901 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.81 
 
 		 947 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.6 
 
 		 901 aa  103  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.6 
 
 		 901 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.6 
 
 		 901 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  27.89 
 
 		 901 aa  101  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  27.89 
 
 		 901 aa  101  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  27.4 
 
 		 1082 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  28.65 
 
 		 899 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.46 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.46 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.46 
 
 		 921 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.74 
 
 		 925 aa  99.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  31.31 
 
 		 960 aa  98.2  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  24.54 
 
 		 901 aa  98.2  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  30.24 
 
 		 1097 aa  97.8  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  31.51 
 
 		 732 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.95 
 
 		 930 aa  96.3  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.12 
 
 		 889 aa  95.5  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.07 
 
 		 896 aa  94  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 907 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.66 
 
 		 935 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.96 
 
 		 894 aa  92.8  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  30.29 
 
 		 1095 aa  93.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 907 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.8 
 
 		 749 aa  92.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.06 
 
 		 900 aa  92.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  23.54 
 
 		 954 aa  92  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>