More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0892 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  100 
 
 		 896 aa  1818    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  68.16 
 
 		 933 aa  1177    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.61 
 
 		 889 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  38.52 
 
 		 905 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  30.02 
 
 		 921 aa  330  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 904 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  29.47 
 
 		 947 aa  312  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  29.49 
 
 		 913 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.1 
 
 		 930 aa  289  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 914 aa  284  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.49 
 
 		 924 aa  277  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.29 
 
 		 932 aa  268  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  26.61 
 
 		 887 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.26 
 
 		 1019 aa  264  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  28.15 
 
 		 900 aa  259  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  29.11 
 
 		 913 aa  251  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.9 
 
 		 901 aa  249  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.7 
 
 		 867 aa  247  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.48 
 
 		 910 aa  247  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 921 aa  241  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.88 
 
 		 914 aa  237  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.48 
 
 		 922 aa  230  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.21 
 
 		 1021 aa  227  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.02 
 
 		 913 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.6 
 
 		 921 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.6 
 
 		 921 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.6 
 
 		 921 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  26.54 
 
 		 914 aa  218  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  27.07 
 
 		 878 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  27.7 
 
 		 914 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.02 
 
 		 894 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0601  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  25.46 
 
 		 901 aa  207  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000493174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.97 
 
 		 930 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  27.26 
 
 		 1336 aa  202  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  29.93 
 
 		 907 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.41 
 
 		 925 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.37 
 
 		 897 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 906 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  28.78 
 
 		 907 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 907 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  26.1 
 
 		 904 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.15 
 
 		 876 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.9 
 
 		 1003 aa  183  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  25.89 
 
 		 924 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.92 
 
 		 877 aa  181  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  24.15 
 
 		 902 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 901 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.27 
 
 		 870 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  32.67 
 
 		 899 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.22 
 
 		 900 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 947 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  29.05 
 
 		 904 aa  174  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  28.9 
 
 		 903 aa  171  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  28.9 
 
 		 903 aa  171  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  26.97 
 
 		 919 aa  171  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.2 
 
 		 896 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.72 
 
 		 917 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.98 
 
 		 897 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.4 
 
 		 947 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.98 
 
 		 955 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  28.8 
 
 		 901 aa  164  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  25.35 
 
 		 960 aa  164  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  28.84 
 
 		 901 aa  162  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  28.6 
 
 		 901 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  28.6 
 
 		 902 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  28.6 
 
 		 901 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  28.6 
 
 		 901 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  27.87 
 
 		 916 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  28.6 
 
 		 901 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  29.4 
 
 		 906 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  30.81 
 
 		 896 aa  158  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7173  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.88 
 
 		 928 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  27.32 
 
 		 902 aa  153  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.82 
 
 		 860 aa  152  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.54 
 
 		 901 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  28.54 
 
 		 901 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  28.54 
 
 		 901 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.77 
 
 		 905 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  28.31 
 
 		 905 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  28.54 
 
 		 901 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  28.07 
 
 		 901 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.54 
 
 		 905 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  28.07 
 
 		 901 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  24.28 
 
 		 1110 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.14 
 
 		 766 aa  149  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  28.31 
 
 		 901 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  28.31 
 
 		 901 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3097  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 898 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0989415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  25.63 
 
 		 944 aa  146  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.25 
 
 		 900 aa  146  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.24 
 
 		 730 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 910 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 905 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1436  GerE family regulatory protein  27 
 
 		 921 aa  144  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.97 
 
 		 911 aa  144  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  31.05 
 
 		 824 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  28.15 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1063  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 917 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1348  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 917 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.554665  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2330  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 917 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>