More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0763 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  100 
 
 
919 aa  1754    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  35.97 
 
 
913 aa  177  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  36.84 
 
 
905 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.7 
 
 
1021 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.01 
 
 
910 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
921 aa  170  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.21 
 
 
901 aa  167  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.4 
 
 
924 aa  164  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.03 
 
 
917 aa  164  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.15 
 
 
877 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  35.36 
 
 
913 aa  157  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  35.22 
 
 
904 aa  157  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  36.5 
 
 
1097 aa  156  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.68 
 
 
930 aa  156  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  33.49 
 
 
896 aa  154  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.1 
 
 
1003 aa  154  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.17 
 
 
867 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.84 
 
 
897 aa  154  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  33.17 
 
 
900 aa  151  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.06 
 
 
870 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.65 
 
 
880 aa  149  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
904 aa  148  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
914 aa  148  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.88 
 
 
913 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  27.48 
 
 
899 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.83 
 
 
896 aa  145  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.86 
 
 
914 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.66 
 
 
876 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  27.03 
 
 
887 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.68 
 
 
921 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.68 
 
 
921 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.68 
 
 
921 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.65 
 
 
894 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  34.83 
 
 
1336 aa  141  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.21 
 
 
766 aa  140  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  32.08 
 
 
947 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.99 
 
 
922 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.03 
 
 
1019 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  32.44 
 
 
907 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  31.42 
 
 
916 aa  140  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.58 
 
 
933 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  32.05 
 
 
901 aa  138  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  33.59 
 
 
903 aa  138  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  33.59 
 
 
903 aa  138  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.59 
 
 
932 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  34.15 
 
 
1110 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  31.6 
 
 
904 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.09 
 
 
889 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 
906 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.06 
 
 
758 aa  132  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  31.26 
 
 
914 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  31.51 
 
 
901 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  33.88 
 
 
924 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  31.51 
 
 
901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  31.51 
 
 
901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  31.51 
 
 
901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  31.51 
 
 
901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  31.51 
 
 
901 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  31.51 
 
 
901 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  31.51 
 
 
901 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  34.62 
 
 
1204 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  28.32 
 
 
902 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  33 
 
 
907 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  32.75 
 
 
906 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  31.93 
 
 
878 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  33.25 
 
 
907 aa  129  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  31.34 
 
 
901 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  31.34 
 
 
901 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  31.34 
 
 
901 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  31.34 
 
 
902 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  28.61 
 
 
902 aa  127  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  31.06 
 
 
901 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  29.03 
 
 
921 aa  126  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  36.61 
 
 
919 aa  126  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.58 
 
 
896 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  30.34 
 
 
1108 aa  125  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.25 
 
 
749 aa  124  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.18 
 
 
947 aa  124  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.98 
 
 
930 aa  124  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  32.78 
 
 
824 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  34.85 
 
 
911 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.14 
 
 
925 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 
910 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  26.01 
 
 
1111 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  32.74 
 
 
905 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 
905 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  30.63 
 
 
920 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  35.75 
 
 
730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
947 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.5 
 
 
905 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  28.47 
 
 
1061 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  31 
 
 
960 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.49 
 
 
911 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  34.85 
 
 
900 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 
905 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0105  transcriptional regulator domain protein  28.37 
 
 
969 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.83 
 
 
900 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  30.02 
 
 
1068 aa  114  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  32.61 
 
 
1145 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  34.91 
 
 
990 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>