144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0140 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0140  ATP-dependent transcriptional regulator  100 
 
 
977 aa  1994    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
921 aa  144  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  22.1 
 
 
1082 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.03 
 
 
897 aa  119  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  29.08 
 
 
917 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.29 
 
 
933 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.77 
 
 
914 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.88 
 
 
901 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  24.63 
 
 
887 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  27.21 
 
 
907 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.5 
 
 
910 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  21.6 
 
 
1000 aa  110  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  21.26 
 
 
1111 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.99 
 
 
1021 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.42 
 
 
870 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.74 
 
 
921 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.51 
 
 
921 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.51 
 
 
921 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1633  tetratricopeptide TPR_4  26.58 
 
 
1031 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.720693  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.25 
 
 
880 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.06 
 
 
846 aa  102  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  22.67 
 
 
1071 aa  102  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.13 
 
 
877 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  27.82 
 
 
907 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.04 
 
 
922 aa  99.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.27 
 
 
867 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 
907 aa  99  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  26.61 
 
 
896 aa  98.2  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  28.24 
 
 
878 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.11 
 
 
1019 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
914 aa  95.1  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  24.82 
 
 
901 aa  94.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.57 
 
 
766 aa  92.8  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  26.42 
 
 
913 aa  92  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  24.08 
 
 
902 aa  92  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  23.7 
 
 
902 aa  91.3  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
947 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.68 
 
 
919 aa  89.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25.31 
 
 
921 aa  89  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.22 
 
 
1003 aa  88.6  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  26.57 
 
 
904 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  23.11 
 
 
1204 aa  88.2  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  27.01 
 
 
900 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.76 
 
 
896 aa  87.4  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  24.76 
 
 
960 aa  86.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  24.42 
 
 
1163 aa  85.9  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.56 
 
 
876 aa  85.1  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.35 
 
 
947 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13097  serine/threonine-protein kinase transcriptional regulatory protein pknK  24.46 
 
 
1110 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  26.62 
 
 
904 aa  84.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.83 
 
 
925 aa  83.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.98 
 
 
860 aa  83.2  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  23.82 
 
 
1061 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.46 
 
 
911 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.93 
 
 
930 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  24.76 
 
 
902 aa  82  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  24.76 
 
 
901 aa  82  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  24.76 
 
 
901 aa  82  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  25.95 
 
 
916 aa  82  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  25.67 
 
 
901 aa  82  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  24.76 
 
 
901 aa  82  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3125  transcriptional activator domain-containing protein  24.39 
 
 
1068 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.99 
 
 
889 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  24.76 
 
 
901 aa  81.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26.91 
 
 
903 aa  81.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26.91 
 
 
903 aa  81.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.81 
 
 
758 aa  80.9  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  25.95 
 
 
919 aa  80.5  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.94 
 
 
913 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.53 
 
 
896 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  25.29 
 
 
1095 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  25.55 
 
 
920 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.87 
 
 
905 aa  78.2  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  21.83 
 
 
1145 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  25.86 
 
 
913 aa  77  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  25.42 
 
 
914 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.06 
 
 
935 aa  77  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  24.5 
 
 
1108 aa  76.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  25.14 
 
 
756 aa  75.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  26.52 
 
 
824 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.39 
 
 
907 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.74 
 
 
900 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  22.71 
 
 
1097 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  24.51 
 
 
910 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  24.55 
 
 
901 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  24.55 
 
 
901 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.44 
 
 
905 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.55 
 
 
901 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3393  regulatory protein, LuxR  25.59 
 
 
900 aa  72.4  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  27.02 
 
 
905 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  24.55 
 
 
901 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  24.55 
 
 
901 aa  72.4  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
905 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  24.55 
 
 
901 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  24.55 
 
 
901 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  24.55 
 
 
901 aa  71.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  25.11 
 
 
1094 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  23.63 
 
 
1336 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.81 
 
 
881 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.56 
 
 
749 aa  70.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>