157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3806 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 423 aa  865    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  40.32 
 
 		 1083 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  38.89 
 
 		 1095 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  38.89 
 
 		 1094 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  39.37 
 
 		 1097 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  31.22 
 
 		 1204 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  36.29 
 
 		 1108 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  34.22 
 
 		 1145 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  34.92 
 
 		 1163 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  37.56 
 
 		 661 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  35.34 
 
 		 1064 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  33.5 
 
 		 1018 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 723 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.03 
 
 		 312 aa  94.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.22 
 
 		 999 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  30.69 
 
 		 1025 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1190 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.15 
 
 		 572 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 1118 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.47 
 
 		 561 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 775 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  28.81 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  31.19 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 1193 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  26.11 
 
 		 1082 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.23 
 
 		 1339 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.41 
 
 		 1126 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  25.97 
 
 		 1111 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  24.93 
 
 		 1061 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28.12 
 
 		 991 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  29.33 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 952 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  21.67 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  26.25 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  30.37 
 
 		 1102 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  25.7 
 
 		 689 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  21.79 
 
 		 365 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  24.9 
 
 		 1054 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  26.02 
 
 		 965 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  24.21 
 
 		 1055 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  26.27 
 
 		 1021 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  25.75 
 
 		 1118 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  25.71 
 
 		 1146 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  24.65 
 
 		 1121 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  25.78 
 
 		 1123 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.42 
 
 		 1067 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  30.86 
 
 		 925 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  26.54 
 
 		 992 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 1116 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  26.38 
 
 		 1092 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0766  tetratricopeptide TPR_4  27.07 
 
 		 1000 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.89 
 
 		 1029 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  26.7 
 
 		 971 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  25.97 
 
 		 1733 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  24.68 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  24 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 647 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  25.23 
 
 		 1042 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 1050 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  29.02 
 
 		 950 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  25.42 
 
 		 1055 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  24.7 
 
 		 775 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 1141 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  24.78 
 
 		 1109 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  22.86 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.11 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  24.61 
 
 		 867 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  29.1 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  33.96 
 
 		 985 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8592  response regulator receiver and SARP domain protein  27.16 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169178  normal  0.403545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  25.1 
 
 		 630 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  27.85 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  23.45 
 
 		 1000 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 1048 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.8 
 
 		 1143 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1552  SARP family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 289 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  0.0981278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  21.17 
 
 		 275 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  24.19 
 
 		 969 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1036 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 282 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  23.72 
 
 		 1090 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  28.24 
 
 		 1100 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  23.5 
 
 		 930 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  22.81 
 
 		 921 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  24.58 
 
 		 1003 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  23.69 
 
 		 1141 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  24.79 
 
 		 1118 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 1027 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  24.79 
 
 		 1118 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 1064 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  23.45 
 
 		 611 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  24.1 
 
 		 1003 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  26.4 
 
 		 1013 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  26.58 
 
 		 940 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  25 
 
 		 996 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3491  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  23.27 
 
 		 360 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  23.08 
 
 		 1150 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>