222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0910 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 
1064 aa  2115    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  32.55 
 
 
1204 aa  164  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  34.29 
 
 
1145 aa  154  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  34.45 
 
 
1097 aa  140  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  29.34 
 
 
1163 aa  131  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  37.07 
 
 
423 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  34.52 
 
 
1108 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  33.19 
 
 
1083 aa  115  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  33.04 
 
 
1094 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  35.39 
 
 
1018 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  32.61 
 
 
1095 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  37.85 
 
 
1025 aa  103  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.58 
 
 
867 aa  99.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.68 
 
 
766 aa  99.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  33.06 
 
 
661 aa  97.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.44 
 
 
911 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  28.46 
 
 
900 aa  93.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
904 aa  88.6  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  25.67 
 
 
916 aa  87.8  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.33 
 
 
924 aa  87.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  28.54 
 
 
920 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.37 
 
 
876 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.89 
 
 
1021 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.72 
 
 
897 aa  85.5  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.4 
 
 
1111 aa  85.5  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  26.24 
 
 
896 aa  85.1  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5812  transcriptional regulator LuxR family  26.63 
 
 
894 aa  85.1  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  26.12 
 
 
905 aa  84.7  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  28.53 
 
 
901 aa  84.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  26.09 
 
 
900 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 
910 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2524  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.53 
 
 
914 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.9975  normal  0.793034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  29.56 
 
 
919 aa  82.8  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  28.75 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.93 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.88 
 
 
930 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 
906 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4838  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.32 
 
 
900 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874018  hitchhiker  0.003849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.85 
 
 
894 aa  82  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  28.54 
 
 
906 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
905 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.19 
 
 
910 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.25 
 
 
905 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  27.32 
 
 
901 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.86 
 
 
901 aa  79.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  27.32 
 
 
901 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  27.1 
 
 
899 aa  79.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.7 
 
 
1190 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.63 
 
 
925 aa  79.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.38 
 
 
901 aa  79  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  27.38 
 
 
901 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  27.38 
 
 
901 aa  79  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.93 
 
 
860 aa  78.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  27.38 
 
 
901 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  27.38 
 
 
901 aa  79  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0954  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
993 aa  78.2  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.656775  normal  0.653362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  27.07 
 
 
901 aa  78.2  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  27.07 
 
 
901 aa  78.2  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  31.15 
 
 
888 aa  78.2  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  27.07 
 
 
902 aa  78.2  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  27.07 
 
 
901 aa  78.2  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.22 
 
 
932 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  26.78 
 
 
901 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.56 
 
 
870 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  25.48 
 
 
917 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  28.76 
 
 
990 aa  77.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.53 
 
 
730 aa  76.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  28.82 
 
 
756 aa  76.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.56 
 
 
999 aa  76.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  27.08 
 
 
901 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.14 
 
 
922 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  27.44 
 
 
903 aa  76.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  27.44 
 
 
903 aa  76.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  28.4 
 
 
904 aa  75.1  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.56 
 
 
913 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  25.19 
 
 
913 aa  75.1  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.5 
 
 
887 aa  73.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.88 
 
 
914 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  26.9 
 
 
919 aa  73.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  26.88 
 
 
904 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  26.69 
 
 
921 aa  73.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  26.41 
 
 
947 aa  73.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  28.76 
 
 
572 aa  73.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  23.65 
 
 
901 aa  72.4  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
914 aa  71.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  26.81 
 
 
921 aa  71.2  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.52 
 
 
935 aa  71.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  29.06 
 
 
878 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.62 
 
 
877 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5021  putative transcriptional regulator  27.89 
 
 
855 aa  70.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00982675  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.71 
 
 
758 aa  70.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0292  hypothetical protein  25.39 
 
 
954 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0090168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  27.23 
 
 
914 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1583  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.96 
 
 
955 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.559531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.16 
 
 
896 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  31.39 
 
 
1126 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1602  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.96 
 
 
897 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208535 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  23.06 
 
 
921 aa  68.9  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  29.29 
 
 
911 aa  68.2  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.06 
 
 
880 aa  68.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>