More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0621 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0621  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  100 
 
 
824 aa  1696    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000506024  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2065  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.76 
 
 
838 aa  251  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  24.67 
 
 
839 aa  204  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  23.88 
 
 
823 aa  194  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.02 
 
 
910 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.41 
 
 
766 aa  105  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.85 
 
 
1021 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  23.99 
 
 
887 aa  93.2  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.34 
 
 
867 aa  92.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1446  LuxR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
921 aa  91.3  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.308791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  25.75 
 
 
900 aa  89.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  26.68 
 
 
906 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  23.9 
 
 
916 aa  89.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.12 
 
 
870 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4031  ATP-dependent transcription regulator LuxR  21.26 
 
 
896 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.924331  normal  0.36139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  24.87 
 
 
906 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  25.98 
 
 
907 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.13 
 
 
1019 aa  82  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.7 
 
 
897 aa  82.4  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.62 
 
 
924 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.19 
 
 
1061 aa  81.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0037  transcriptional regulator MalT  24.57 
 
 
901 aa  81.3  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.3 
 
 
925 aa  81.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  24.6 
 
 
907 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  25.06 
 
 
904 aa  80.9  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001102  transcriptional activator of maltose regulon MalT  23.31 
 
 
902 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04848  transcriptional regulator MalT  23.31 
 
 
902 aa  79  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.14 
 
 
911 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  24.27 
 
 
903 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.07 
 
 
884 aa  76.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  24.27 
 
 
903 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.97 
 
 
905 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.64 
 
 
894 aa  75.5  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.57 
 
 
758 aa  75.5  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  24.6 
 
 
901 aa  75.5  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.97 
 
 
1111 aa  75.1  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  25.27 
 
 
907 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  23.87 
 
 
910 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.65 
 
 
880 aa  74.7  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0162  ATP-dependent transcriptional regulator-like  23.82 
 
 
756 aa  73.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25 
 
 
935 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  24.09 
 
 
919 aa  72.4  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.93 
 
 
877 aa  72.4  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.3 
 
 
921 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.3 
 
 
921 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.3 
 
 
921 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  24.71 
 
 
919 aa  71.6  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3699  transcriptional regulator MalT  23.38 
 
 
901 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203267  normal  0.15955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  21.76 
 
 
1003 aa  70.9  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03270  transcriptional regulator MalT  23.38 
 
 
901 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00934962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  23.38 
 
 
901 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  23.46 
 
 
901 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  24.32 
 
 
920 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4725  transcriptional regulator MalT  23.38 
 
 
901 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3789  transcriptional regulator MalT  23.46 
 
 
901 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.53 
 
 
922 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3616  transcriptional regulator MalT  23.38 
 
 
901 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  23.85 
 
 
904 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0295  transcriptional regulator MalT  23.38 
 
 
901 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.67 
 
 
876 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03222  hypothetical protein  23.38 
 
 
901 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00528923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3717  transcriptional regulator MalT  23.46 
 
 
901 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3894  transcriptional regulator MalT  23.38 
 
 
901 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3885  transcriptional regulator MalT  23.46 
 
 
902 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  23.46 
 
 
901 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  23.1 
 
 
917 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.56 
 
 
947 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.05 
 
 
846 aa  68.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
212 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  22.16 
 
 
914 aa  68.2  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.86 
 
 
930 aa  67.8  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  22.41 
 
 
904 aa  67.8  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.73 
 
 
913 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
905 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  23.7 
 
 
905 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  24.07 
 
 
947 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0120  transcriptional regulator MalT  25 
 
 
921 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  27.18 
 
 
1094 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  23.69 
 
 
905 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  23.73 
 
 
913 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  22.4 
 
 
914 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  21.49 
 
 
960 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.49 
 
 
309 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  23.26 
 
 
896 aa  65.1  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 
224 aa  64.7  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.98 
 
 
907 aa  65.1  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  23.02 
 
 
901 aa  64.7  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4082  regulatory protein, LuxR  24.63 
 
 
888 aa  64.3  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.566011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  22.47 
 
 
914 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  37.5 
 
 
873 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  23.91 
 
 
717 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  28.91 
 
 
1018 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  26.85 
 
 
878 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 
224 aa  63.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  53.85 
 
 
224 aa  63.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  23.55 
 
 
924 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 
222 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
970 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 
901 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  32.48 
 
 
933 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>