More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3158 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  100 
 
 		 446 aa  880    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  55.94 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  50.2 
 
 		 312 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 268 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.21 
 
 		 965 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.43 
 
 		 1190 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.21 
 
 		 931 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 970 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 1193 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.13 
 
 		 950 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.84 
 
 		 1121 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  29.13 
 
 		 1097 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  29.01 
 
 		 1088 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  31.03 
 
 		 1114 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 760 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 654 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.83 
 
 		 1339 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.43 
 
 		 1017 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.3 
 
 		 1123 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.45 
 
 		 1027 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  28.97 
 
 		 1010 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  32.73 
 
 		 1733 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 1118 aa  77  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.46 
 
 		 1146 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.76 
 
 		 621 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.33 
 
 		 1150 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  29.62 
 
 		 981 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.11 
 
 		 1013 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 		 1003 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 1000 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 1071 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  30.16 
 
 		 1033 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 1141 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 1148 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  30.11 
 
 		 597 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  27.95 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.15 
 
 		 1022 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 370 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  27.91 
 
 		 535 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  30.87 
 
 		 1018 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.83 
 
 		 1054 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  30.57 
 
 		 1123 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 1048 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  29.79 
 
 		 1021 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.28 
 
 		 957 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  28.91 
 
 		 1018 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  29.46 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  25.78 
 
 		 1108 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.63 
 
 		 971 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  27.53 
 
 		 1083 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.51 
 
 		 921 aa  70.1  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  31.02 
 
 		 676 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  29.03 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 1151 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  31.52 
 
 		 1005 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  30.25 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 		 992 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  31.82 
 
 		 941 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  27.24 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  30.51 
 
 		 833 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.51 
 
 		 1090 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30.86 
 
 		 1118 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  27.1 
 
 		 278 aa  67  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 921 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 602 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.26 
 
 		 960 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.08 
 
 		 1025 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.15 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  30.2 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  31.97 
 
 		 1072 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  24.28 
 
 		 1163 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 952 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  28.62 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  28.74 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  29.82 
 
 		 937 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.59 
 
 		 969 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  27.76 
 
 		 908 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  31.35 
 
 		 1102 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  31.78 
 
 		 1005 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  24.8 
 
 		 631 aa  63.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  30 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.98 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 993 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  27.97 
 
 		 907 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  30.31 
 
 		 1014 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  30 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  28.74 
 
 		 943 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  28.85 
 
 		 1093 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  26.64 
 
 		 1003 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  25.78 
 
 		 930 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>