More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4017 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 535 aa  1082    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  41.84 
 
 		 1021 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.64 
 
 		 957 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.3 
 
 		 971 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  39.75 
 
 		 1025 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 1093 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  39 
 
 		 1088 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 654 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 621 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.73 
 
 		 940 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  36.65 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 993 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.6 
 
 		 1339 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 268 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 370 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.27 
 
 		 950 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.84 
 
 		 1013 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 1108 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  35.54 
 
 		 1010 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 996 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 		 969 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.33 
 
 		 960 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 965 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  34.14 
 
 		 621 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  36.99 
 
 		 1102 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 268 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 1058 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 1000 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 1003 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 990 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.73 
 
 		 631 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 1158 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 952 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 1151 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.77 
 
 		 1055 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.77 
 
 		 1125 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 990 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 981 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 1058 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.72 
 
 		 921 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 921 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 962 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 1043 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 622 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1004 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  31.02 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  32.3 
 
 		 379 aa  117  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 1020 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 1100 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  33.74 
 
 		 992 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 1110 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  40.91 
 
 		 1087 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 1022 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  30.43 
 
 		 267 aa  114  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 1014 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  30.65 
 
 		 252 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  32.65 
 
 		 1123 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.8 
 
 		 1017 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.68 
 
 		 992 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 1048 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.3 
 
 		 943 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  34.77 
 
 		 1092 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 760 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 943 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 276 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  31.33 
 
 		 1733 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  35.24 
 
 		 1048 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 931 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  34 
 
 		 941 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  36.36 
 
 		 1118 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  32.82 
 
 		 1030 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  36.64 
 
 		 1066 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 1141 aa  110  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.24 
 
 		 981 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  37.24 
 
 		 1056 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.02 
 
 		 1018 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 928 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 989 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  33.6 
 
 		 1699 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.68 
 
 		 496 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 1003 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 292 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.25 
 
 		 1017 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 1319 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  33.08 
 
 		 1121 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 994 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.2 
 
 		 1036 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  30.86 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 		 970 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.17 
 
 		 1025 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  33.22 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.08 
 
 		 1072 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 1027 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  29.51 
 
 		 919 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  34.05 
 
 		 582 aa  104  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.71 
 
 		 919 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  32.83 
 
 		 1114 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.62 
 
 		 995 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>