More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1115 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 225 aa  443  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.53 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.55 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  33.18 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  35.91 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.87 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  32.42 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  35.98 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.29 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 213 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  29.77 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.72 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  32.87 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 1648 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.66 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  37.5 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  34.1 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  35.02 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 		 592 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  32.23 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 224 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 595 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 303 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  33.78 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  37.79 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  31.94 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  40.14 
 
 		 449 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.18 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  27.73 
 
 		 595 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.63 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>