More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2867 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  100 
 
 		 449 aa  882    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  55.94 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  47.08 
 
 		 312 aa  226  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  34.24 
 
 		 1123 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.2 
 
 		 1150 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.45 
 
 		 965 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.48 
 
 		 1339 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 1190 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 969 aa  97.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32.82 
 
 		 950 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 1141 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  34.4 
 
 		 1123 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 1148 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 760 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  33.82 
 
 		 1146 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.78 
 
 		 1121 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  34.93 
 
 		 221 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.88 
 
 		 496 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 207 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  31.85 
 
 		 1114 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.94 
 
 		 1003 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.14 
 
 		 225 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  33.72 
 
 		 535 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 268 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  33.6 
 
 		 1092 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 1054 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 216 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 241 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 		 253 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  30 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  34.78 
 
 		 242 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  29.32 
 
 		 621 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 234 aa  87  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 		 1022 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 655 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  32.68 
 
 		 957 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.98 
 
 		 1018 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1151 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.56 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 723 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 1193 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 1017 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 992 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10690  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.42 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  33.71 
 
 		 1088 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 234 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 212 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  30.77 
 
 		 611 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 213 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  33.2 
 
 		 1733 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 212 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  26.54 
 
 		 1097 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 1141 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 1141 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  30.98 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.57 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  28.87 
 
 		 211 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 952 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  30.03 
 
 		 1090 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  33.48 
 
 		 937 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.82 
 
 		 1163 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  33.83 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.12 
 
 		 661 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 1000 aa  80.1  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  30.54 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  30.87 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 1071 aa  80.1  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 931 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 211 aa  79.7  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  34.5 
 
 		 960 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  32.41 
 
 		 1021 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  29.93 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  27.39 
 
 		 1145 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  31.32 
 
 		 1010 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.61 
 
 		 1097 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>