More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2413 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 760 aa  1487    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  43.31 
 
 		 378 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  46.81 
 
 		 937 aa  170  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  44.35 
 
 		 970 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 268 aa  163  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 1071 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  42.31 
 
 		 1000 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  38.27 
 
 		 1021 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  40 
 
 		 979 aa  144  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 957 aa  144  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  39.85 
 
 		 992 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.18 
 
 		 960 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  39.26 
 
 		 1088 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  37.99 
 
 		 1123 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  43.19 
 
 		 994 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 		 969 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.52 
 
 		 921 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.76 
 
 		 919 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 1005 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  40.56 
 
 		 950 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  37.74 
 
 		 993 aa  130  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  37.26 
 
 		 1733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.11 
 
 		 1108 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  37.59 
 
 		 1013 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  35.04 
 
 		 1022 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  35.53 
 
 		 833 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.72 
 
 		 931 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 453 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.13 
 
 		 621 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.06 
 
 		 989 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  38.3 
 
 		 940 aa  128  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 622 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.32 
 
 		 1092 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  38.74 
 
 		 990 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.72 
 
 		 1102 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  40.89 
 
 		 954 aa  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.7 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 292 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 267 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.3 
 
 		 1158 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  31.78 
 
 		 956 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 962 aa  118  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 1010 aa  118  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 1014 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  36.92 
 
 		 278 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  33.14 
 
 		 535 aa  117  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  41.07 
 
 		 919 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 971 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.67 
 
 		 983 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.92 
 
 		 1125 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 1004 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 1020 aa  114  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  35.86 
 
 		 934 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  34.85 
 
 		 261 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 1025 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.79 
 
 		 1100 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 282 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 489 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 1141 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 963 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  38.4 
 
 		 1123 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 981 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 276 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  39.06 
 
 		 1090 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  35.48 
 
 		 1121 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 1034 aa  110  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 1141 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 1141 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  36.44 
 
 		 690 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  26.3 
 
 		 965 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.05 
 
 		 1339 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  36.86 
 
 		 1018 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  33.7 
 
 		 982 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  34.38 
 
 		 981 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.04 
 
 		 996 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  36.19 
 
 		 379 aa  108  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 941 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  30 
 
 		 790 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  34.88 
 
 		 1118 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 1148 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 1161 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.27 
 
 		 965 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  38.62 
 
 		 1025 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  33.07 
 
 		 252 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33 
 
 		 990 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  39.68 
 
 		 963 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 943 aa  104  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3688  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 		 348 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 1186 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 993 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  29.86 
 
 		 788 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  35.92 
 
 		 1103 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  35.74 
 
 		 1699 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.16 
 
 		 907 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  35.29 
 
 		 385 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.4 
 
 		 964 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.42 
 
 		 1003 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 655 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  38.34 
 
 		 1030 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  27.76 
 
 		 792 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>