240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3100 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  43.08 
 
 		 1000 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 654 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  39.5 
 
 		 1022 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  39.84 
 
 		 1733 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.77 
 
 		 1339 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  38.71 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 1108 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  41.04 
 
 		 957 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.26 
 
 		 1030 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.08 
 
 		 496 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 981 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  39.43 
 
 		 1020 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  34.47 
 
 		 388 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 453 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  42.04 
 
 		 1025 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.59 
 
 		 1093 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 1100 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.46 
 
 		 950 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  39.66 
 
 		 1121 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  41.6 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  36.91 
 
 		 621 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.95 
 
 		 631 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  42.15 
 
 		 935 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  39.52 
 
 		 960 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.08 
 
 		 965 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  32.94 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  34.94 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  34.84 
 
 		 1014 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  39.82 
 
 		 954 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  41.79 
 
 		 1132 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  35.15 
 
 		 379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 981 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.22 
 
 		 921 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.57 
 
 		 1004 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 931 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 979 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 952 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.4 
 
 		 990 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 992 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  39.61 
 
 		 1110 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  39.52 
 
 		 962 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  39.39 
 
 		 668 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  39.93 
 
 		 1161 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 968 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 621 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 1043 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 622 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.2 
 
 		 919 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 1186 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  34.4 
 
 		 1123 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  39.04 
 
 		 1088 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  41.46 
 
 		 1146 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 934 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.71 
 
 		 1003 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.45 
 
 		 1010 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.55 
 
 		 1013 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 1148 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  36.08 
 
 		 1699 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.38 
 
 		 1072 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  42.45 
 
 		 1092 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 1005 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.88 
 
 		 996 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  36.97 
 
 		 1118 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 1021 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.45 
 
 		 990 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  41.78 
 
 		 926 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  34.02 
 
 		 833 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 921 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 489 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.14 
 
 		 930 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 535 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 1048 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  36.4 
 
 		 1011 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.2 
 
 		 940 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.98 
 
 		 993 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  38.65 
 
 		 1050 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  35.41 
 
 		 385 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 983 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.76 
 
 		 969 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.13 
 
 		 1058 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 1151 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5071  SARP family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.75 
 
 		 1097 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 1036 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  37.44 
 
 		 937 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  37.3 
 
 		 1150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 		 995 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 1094 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 		 956 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 1158 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 1027 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 907 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>