248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0386 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  46.8 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  44.88 
 
 		 1000 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  45.68 
 
 		 1339 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  41.76 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  45.77 
 
 		 950 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  46.01 
 
 		 1088 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  43.77 
 
 		 940 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  44.08 
 
 		 981 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  44.9 
 
 		 1020 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  43.14 
 
 		 496 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  42.8 
 
 		 992 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  42.54 
 
 		 1733 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 969 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 654 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 621 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  42.37 
 
 		 1102 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  39.36 
 
 		 1022 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  45.2 
 
 		 960 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 1005 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 622 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  42.69 
 
 		 1092 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 1071 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  39.04 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 760 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  42.7 
 
 		 1030 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  39.54 
 
 		 833 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 489 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  44.27 
 
 		 1103 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  42 
 
 		 1013 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  40.68 
 
 		 934 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  40.48 
 
 		 1123 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  41.39 
 
 		 921 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  40.3 
 
 		 1118 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  41.31 
 
 		 1025 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  45.58 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  45 
 
 		 1110 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  39.84 
 
 		 1003 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 1097 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  38.17 
 
 		 1108 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  41.6 
 
 		 668 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  40.33 
 
 		 453 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  41.76 
 
 		 1100 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 979 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  39.36 
 
 		 388 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  38.91 
 
 		 983 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  39.29 
 
 		 1699 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 621 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40 
 
 		 919 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  40.78 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  38.87 
 
 		 1014 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  41.18 
 
 		 954 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.2 
 
 		 631 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 957 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  42.15 
 
 		 1043 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  38.38 
 
 		 965 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.7 
 
 		 1055 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  39.29 
 
 		 1121 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 1028 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 1161 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 968 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  43.09 
 
 		 935 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 		 990 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  41.57 
 
 		 1125 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.08 
 
 		 1186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 981 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  39.38 
 
 		 1021 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  41.26 
 
 		 1017 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  40 
 
 		 931 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 1346 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  38.55 
 
 		 1010 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  40.24 
 
 		 655 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 952 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  41.2 
 
 		 676 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 995 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  38.06 
 
 		 921 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  37.93 
 
 		 1090 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.19 
 
 		 993 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  40.93 
 
 		 1093 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 1004 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 1319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  40.55 
 
 		 1048 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  39.57 
 
 		 582 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.55 
 
 		 1158 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  37.15 
 
 		 1027 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 989 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  39.26 
 
 		 370 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  40.08 
 
 		 266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  39.59 
 
 		 1058 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.8 
 
 		 1018 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.98 
 
 		 1087 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  39.52 
 
 		 941 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  39.11 
 
 		 1033 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 535 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  38.98 
 
 		 1114 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>