More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0749 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  100 
 
 		 1090 aa  2140    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  38.82 
 
 		 1118 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  36.62 
 
 		 1121 aa  466  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.47 
 
 		 1150 aa  426  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  33.21 
 
 		 1123 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 1036 aa  362  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  33.97 
 
 		 1123 aa  354  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  32.52 
 
 		 1114 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  30.57 
 
 		 1132 aa  251  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 1161 aa  247  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  34.17 
 
 		 1071 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 1141 aa  205  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 489 aa  201  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  51.05 
 
 		 655 aa  196  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.75 
 
 		 1148 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  44.81 
 
 		 1153 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 1141 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 1141 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  53.04 
 
 		 676 aa  179  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  43.02 
 
 		 969 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 1151 aa  174  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 1141 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.64 
 
 		 1146 aa  171  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.16 
 
 		 965 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  43.5 
 
 		 647 aa  164  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  46.15 
 
 		 611 aa  161  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.93 
 
 		 1339 aa  157  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  48 
 
 		 628 aa  154  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  39.78 
 
 		 1000 aa  154  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  36.31 
 
 		 981 aa  154  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.56 
 
 		 1017 aa  151  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.39 
 
 		 1003 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  39.25 
 
 		 931 aa  147  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 1118 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 1005 aa  143  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  36.31 
 
 		 934 aa  142  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.11 
 
 		 1092 aa  141  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  37.69 
 
 		 1018 aa  141  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.62 
 
 		 940 aa  140  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  36.45 
 
 		 1733 aa  140  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 268 aa  135  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.92 
 
 		 1102 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.01 
 
 		 957 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.12 
 
 		 1022 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.41 
 
 		 1010 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 1071 aa  132  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.34 
 
 		 1125 aa  131  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.46 
 
 		 1103 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  35.22 
 
 		 990 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 		 943 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 1088 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 654 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  33.52 
 
 		 1158 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 		 1004 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.29 
 
 		 496 aa  125  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.67 
 
 		 962 aa  125  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 276 aa  125  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 915 aa  125  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 723 aa  124  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  36.16 
 
 		 378 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  34.76 
 
 		 1030 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  36.19 
 
 		 1097 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  34.57 
 
 		 1017 aa  122  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.83 
 
 		 963 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 1186 aa  121  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 621 aa  121  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 		 990 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 1043 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  37.08 
 
 		 885 aa  120  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 1100 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  36.25 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 952 aa  119  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  40.64 
 
 		 926 aa  119  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  36.28 
 
 		 910 aa  119  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  36.43 
 
 		 385 aa  118  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 622 aa  118  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  41.23 
 
 		 668 aa  117  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 453 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.88 
 
 		 1013 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.49 
 
 		 1014 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.8 
 
 		 950 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  36.76 
 
 		 1011 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.14 
 
 		 1055 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 921 aa  115  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  34.97 
 
 		 1025 aa  115  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 1028 aa  114  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 910 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  40.08 
 
 		 1025 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  34.46 
 
 		 1054 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.34 
 
 		 1054 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 963 aa  113  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  30.19 
 
 		 621 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.8 
 
 		 960 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 1141 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 760 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.88 
 
 		 1029 aa  111  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.9 
 
 		 1058 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 		 1093 aa  111  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  34.62 
 
 		 379 aa  111  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  25.84 
 
 		 1022 aa  111  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>