More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3190 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  100 
 
 		 919 aa  1763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 979 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  41.83 
 
 		 833 aa  455  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 968 aa  296  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  54 
 
 		 266 aa  232  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  45.42 
 
 		 1000 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  43.18 
 
 		 1733 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  41.83 
 
 		 1108 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  40.08 
 
 		 1022 aa  174  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 		 1094 aa  173  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.53 
 
 		 1142 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  40.27 
 
 		 378 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  43.73 
 
 		 940 aa  166  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 957 aa  164  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  43.39 
 
 		 453 aa  159  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  42.75 
 
 		 1020 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  39.68 
 
 		 981 aa  154  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  40.32 
 
 		 921 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 950 aa  152  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 622 aa  151  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  44.44 
 
 		 1072 aa  151  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 654 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.76 
 
 		 1117 aa  148  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  40 
 
 		 268 aa  147  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  39.63 
 
 		 934 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  38.37 
 
 		 1004 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  37.31 
 
 		 1021 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  39.6 
 
 		 388 aa  144  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.82 
 
 		 621 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  39.24 
 
 		 1102 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  41.13 
 
 		 1014 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  41.27 
 
 		 969 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 981 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.97 
 
 		 496 aa  140  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  38.31 
 
 		 1003 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  43.65 
 
 		 385 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  40.73 
 
 		 931 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.98 
 
 		 631 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  42.45 
 
 		 960 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 276 aa  138  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 1058 aa  138  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 		 1198 aa  137  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.68 
 
 		 965 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  40.07 
 
 		 1030 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 621 aa  137  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  42.26 
 
 		 1110 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 1048 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  35.2 
 
 		 1123 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.67 
 
 		 1055 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 1093 aa  134  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  40.64 
 
 		 1125 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 952 aa  134  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  36.5 
 
 		 1011 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  39.36 
 
 		 1699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  38.72 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  41.56 
 
 		 954 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  40.08 
 
 		 1141 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  36.58 
 
 		 1010 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  37.15 
 
 		 995 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.3 
 
 		 1186 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 760 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.7 
 
 		 1158 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  33.85 
 
 		 267 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.12 
 
 		 946 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 1100 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  38.55 
 
 		 992 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  38.21 
 
 		 993 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  40.4 
 
 		 1103 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  36.47 
 
 		 1013 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 1022 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  38.15 
 
 		 1043 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 1071 aa  128  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  38.62 
 
 		 1118 aa  128  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.6 
 
 		 1056 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  33.73 
 
 		 261 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  38.74 
 
 		 264 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 1141 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 1141 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.12 
 
 		 1027 aa  126  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  35.48 
 
 		 278 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 370 aa  125  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 602 aa  125  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 268 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  36 
 
 		 297 aa  124  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  39.2 
 
 		 1005 aa  124  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  27.1 
 
 		 1148 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 943 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  40.08 
 
 		 1092 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.73 
 
 		 1226 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 		 1160 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.23 
 
 		 1081 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  40.4 
 
 		 1097 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 1066 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.44 
 
 		 1017 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 1088 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 1148 aa  121  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 921 aa  120  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  38.65 
 
 		 941 aa  120  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  38.89 
 
 		 1121 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 996 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>