More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4842 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 979 aa  1904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  40.33 
 
 		 919 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  38.2 
 
 		 833 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 968 aa  233  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  51.53 
 
 		 266 aa  202  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  44.67 
 
 		 1108 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  44.79 
 
 		 1000 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  37.54 
 
 		 1010 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  42.28 
 
 		 1004 aa  175  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  42.4 
 
 		 1022 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  43.75 
 
 		 378 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  44.3 
 
 		 453 aa  168  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  42.39 
 
 		 1020 aa  168  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 957 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  40.48 
 
 		 1103 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 654 aa  165  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  41.6 
 
 		 1733 aa  164  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  39.65 
 
 		 940 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  40.73 
 
 		 981 aa  161  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 268 aa  161  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  38.33 
 
 		 1125 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.89 
 
 		 960 aa  160  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  40.62 
 
 		 1102 aa  159  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 1100 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 622 aa  157  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  40.94 
 
 		 1088 aa  156  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  38.18 
 
 		 1030 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  36.79 
 
 		 388 aa  153  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 760 aa  154  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  38.87 
 
 		 934 aa  154  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 621 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 		 1198 aa  153  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  44.58 
 
 		 954 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.33 
 
 		 1014 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 969 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 1158 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  42.74 
 
 		 950 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  42.23 
 
 		 1058 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  43.67 
 
 		 1110 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.01 
 
 		 1092 aa  148  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.45 
 
 		 1003 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 621 aa  147  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  40.91 
 
 		 931 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  33.44 
 
 		 1027 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 1093 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 267 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  40.15 
 
 		 993 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.85 
 
 		 965 aa  144  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 		 1142 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.03 
 
 		 631 aa  142  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  43.31 
 
 		 1072 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  40.4 
 
 		 1005 aa  141  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  40.41 
 
 		 941 aa  141  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 1186 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 946 aa  140  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 1071 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.6 
 
 		 496 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 		 1094 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 995 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  38.89 
 
 		 1123 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.55 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.65 
 
 		 1055 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 992 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  35.6 
 
 		 297 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  39.09 
 
 		 1017 aa  135  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  36.52 
 
 		 1118 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 1028 aa  134  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  40.98 
 
 		 992 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  37.76 
 
 		 370 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.34 
 
 		 1160 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 990 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4209  transcriptional regulator, SARP family  37.55 
 
 		 271 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.45 
 
 		 1017 aa  132  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  36.9 
 
 		 1011 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  37.28 
 
 		 996 aa  131  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  36.36 
 
 		 1033 aa  131  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  41.34 
 
 		 1161 aa  131  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 983 aa  130  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 489 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 1094 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  36.03 
 
 		 981 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 962 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  37.69 
 
 		 262 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  39.26 
 
 		 989 aa  128  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 967 aa  129  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 956 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  40.47 
 
 		 1123 aa  128  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 1058 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 379 aa  127  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 921 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.75 
 
 		 1048 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  38.55 
 
 		 1018 aa  126  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  41.63 
 
 		 1056 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  39.92 
 
 		 385 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 1022 aa  125  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  38.49 
 
 		 1097 aa  124  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  37.4 
 
 		 1013 aa  124  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  37.05 
 
 		 1699 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 276 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  37.19 
 
 		 1021 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>