229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1244 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1244  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 312 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  50.2 
 
 		 446 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  47.08 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  34.98 
 
 		 965 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.56 
 
 		 1121 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  30.45 
 
 		 1123 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 1000 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  32 
 
 		 1071 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  31.98 
 
 		 952 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.44 
 
 		 1114 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.25 
 
 		 1018 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  34.36 
 
 		 1072 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 921 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  30.24 
 
 		 1118 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  32.42 
 
 		 921 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.22 
 
 		 1150 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  28.83 
 
 		 597 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 602 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 950 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 1141 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  28.69 
 
 		 1090 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.69 
 
 		 1339 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  30.63 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  29.92 
 
 		 931 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  29.1 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 1148 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.45 
 
 		 1193 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 1093 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 1190 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.18 
 
 		 1054 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 1118 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  31.74 
 
 		 1003 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  30.56 
 
 		 1005 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.72 
 
 		 957 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  32.4 
 
 		 775 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  27.38 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 946 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  30.4 
 
 		 1025 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  30.93 
 
 		 1066 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 978 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  29.3 
 
 		 611 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.43 
 
 		 1071 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0476  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 639 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 1097 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  31.25 
 
 		 1017 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  29.65 
 
 		 963 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  31.8 
 
 		 1088 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 621 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 1082 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 1058 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 969 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.66 
 
 		 1123 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  28.88 
 
 		 1042 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  30.18 
 
 		 992 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  28.52 
 
 		 907 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 928 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 1013 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 1027 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  30.57 
 
 		 1055 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.04 
 
 		 1092 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  27.64 
 
 		 930 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  29.11 
 
 		 1005 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  29.84 
 
 		 1186 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.26 
 
 		 960 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  24.9 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 676 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  28.18 
 
 		 655 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  28.64 
 
 		 994 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  25.93 
 
 		 1071 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  27.59 
 
 		 943 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30 
 
 		 1146 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  29.61 
 
 		 630 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 1021 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  28.51 
 
 		 1003 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  29.8 
 
 		 1733 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 1043 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 940 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  26.09 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  31.86 
 
 		 1103 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.03 
 
 		 1100 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.06 
 
 		 990 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  28.91 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 760 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  23.33 
 
 		 1163 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.96 
 
 		 919 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.49 
 
 		 631 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  28.72 
 
 		 990 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  24.39 
 
 		 1204 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  30.71 
 
 		 965 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 630 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  27.71 
 
 		 941 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  24.41 
 
 		 1108 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>